More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B5645 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  93.85 
 
 		 374 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  88.5 
 
 		 449 aa  683    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  87.17 
 
 		 449 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  86.9 
 
 		 451 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  87.97 
 
 		 449 aa  686    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  88.24 
 
 		 451 aa  686    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  87.17 
 
 		 449 aa  678    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  86.9 
 
 		 449 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  84.76 
 
 		 450 aa  658    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  100 
 
 		 374 aa  771    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  72.46 
 
 		 449 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  57.37 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  53.62 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  41.97 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  38.21 
 
 		 425 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  37.23 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  42.2 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  39.08 
 
 		 426 aa  248  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  38.29 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  38.32 
 
 		 623 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  37.1 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  37.1 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  36.21 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  35.53 
 
 		 716 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  24.93 
 
 		 1167 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  24.93 
 
 		 1167 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  26.42 
 
 		 1169 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  25.39 
 
 		 1158 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  25.32 
 
 		 1168 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  24.85 
 
 		 1153 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.11 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1109 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1158 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  23.36 
 
 		 1103 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  25.54 
 
 		 1192 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.07 
 
 		 673 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  25.91 
 
 		 1192 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  25.91 
 
 		 1193 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  24.55 
 
 		 1121 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1188 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  25.46 
 
 		 1202 aa  58.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  24.34 
 
 		 1109 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0937  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.68 
 
 		 938 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0616253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  22.8 
 
 		 1126 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  22.77 
 
 		 1127 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  23.08 
 
 		 1099 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.98 
 
 		 675 aa  56.2  0.0000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  25.75 
 
 		 1180 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  21.47 
 
 		 1120 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  25.3 
 
 		 1169 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.1 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  25.4 
 
 		 1183 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  24.21 
 
 		 1112 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  25.46 
 
 		 1176 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  25.9 
 
 		 1188 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  23.05 
 
 		 1165 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1176 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.08 
 
 		 671 aa  53.5  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  23.73 
 
 		 768 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  24.45 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  23.87 
 
 		 1179 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  24.05 
 
 		 1165 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.8 
 
 		 685 aa  53.1  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  25.39 
 
 		 1224 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3341  primosome assembly protein PriA  25.47 
 
 		 761 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000327838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  23.15 
 
 		 1155 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  25.33 
 
 		 1115 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1178 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.23 
 
 		 556 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.75 
 
 		 1166 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  23.64 
 
 		 1211 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  24.54 
 
 		 1176 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  22.02 
 
 		 754 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  25.73 
 
 		 801 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  23.59 
 
 		 1168 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  23.92 
 
 		 1169 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  23.86 
 
 		 1218 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  23.59 
 
 		 1168 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  26.06 
 
 		 768 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  26.67 
 
 		 765 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30585  predicted protein  23.05 
 
 		 942 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  23.01 
 
 		 1116 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1150 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  23.93 
 
 		 1211 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43765  predicted protein  31.5 
 
 		 690 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0853218 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.35 
 
 		 679 aa  50.8  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  22.8 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  23.93 
 
 		 1211 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  23.93 
 
 		 1211 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  23.61 
 
 		 1212 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82655  ATP-dependent RNA helicase CA3 of the DEAD/DEAH box family  23.62 
 
 		 526 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  26.67 
 
 		 765 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  20.86 
 
 		 1107 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>