More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82655 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_82655  ATP-dependent RNA helicase CA3 of the DEAD/DEAH box family  100 
 
 
526 aa  1076    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00590  conserved hypothetical protein  50.33 
 
 
605 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38084  predicted protein  51.02 
 
 
440 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07424  ATP-dependent RNA helicase dbp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWA6]  51.82 
 
 
413 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000152071 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10782  predicted protein  46.99 
 
 
417 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05931  ATP-dependent RNA helicase dbp2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0J9]  44.15 
 
 
563 aa  335  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111979  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01240  p68-like protein, putative  42.24 
 
 
540 aa  325  9e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  43.73 
 
 
421 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82821  DEAD box RNA helicase  42.82 
 
 
530 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283146  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  42.4 
 
 
529 aa  309  5.9999999999999995e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47095  predicted protein  45.45 
 
 
413 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0903334  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27227  predicted protein  44.05 
 
 
452 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.689197 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36611  predicted protein  44.05 
 
 
452 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438813  decreased coverage  0.000242961 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  39.85 
 
 
480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
482 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.06 
 
 
556 aa  276  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.42 
 
 
497 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.42 
 
 
511 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.87 
 
 
482 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  41.87 
 
 
482 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.87 
 
 
482 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  41.87 
 
 
482 aa  276  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  41.87 
 
 
481 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  41.87 
 
 
482 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.87 
 
 
559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.15 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.87 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  40.15 
 
 
616 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  42.15 
 
 
527 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.44 
 
 
537 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.42 
 
 
520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  42.42 
 
 
520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.42 
 
 
520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.18 
 
 
507 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  40.7 
 
 
552 aa  268  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.5 
 
 
489 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.05 
 
 
491 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01266  Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase prp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW4]  39.8 
 
 
1173 aa  266  8.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505248  normal  0.0523257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.62 
 
 
565 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.24 
 
 
493 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  39.62 
 
 
495 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.24 
 
 
493 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.21 
 
 
482 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.21 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.11 
 
 
479 aa  263  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.65 
 
 
439 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.51 
 
 
471 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 
599 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.82 
 
 
545 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  38.6 
 
 
668 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.34 
 
 
464 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.42 
 
 
491 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.62 
 
 
473 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.15 
 
 
535 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  39.95 
 
 
510 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.35 
 
 
578 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  42.06 
 
 
503 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 
527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  40.39 
 
 
421 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.8 
 
 
549 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.15 
 
 
549 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.88 
 
 
537 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  40.22 
 
 
419 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.15 
 
 
467 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.61 
 
 
463 aa  257  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 
477 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
526 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0163  ATP-dependent RNA helicase  40.17 
 
 
446 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
525 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
525 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0145  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.17 
 
 
446 aa  257  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  41.86 
 
 
445 aa  257  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.74 
 
 
515 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1916  hypothetical protein  37.47 
 
 
575 aa  256  6e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.42 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39 
 
 
583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.04 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.01 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 
494 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.61 
 
 
480 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  39.69 
 
 
637 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.47 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0429  putative ATP-dependent RNA helicase 1  39.12 
 
 
418 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 
460 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.9 
 
 
494 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.83 
 
 
436 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.01 
 
 
479 aa  254  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.29 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.11 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.03 
 
 
452 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.74 
 
 
535 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  39.29 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.1 
 
 
496 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.96 
 
 
472 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.54 
 
 
497 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  41.69 
 
 
445 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  41.44 
 
 
495 aa  253  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.2 
 
 
506 aa  252  9.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.74 
 
 
535 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>