More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0981 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
405 aa  818    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.02 
 
 
467 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.21 
 
 
532 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.05 
 
 
530 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.47 
 
 
466 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 
584 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.82 
 
 
538 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  50.83 
 
 
528 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  50.41 
 
 
579 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.04 
 
 
531 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  46.7 
 
 
572 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  50.27 
 
 
529 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.32 
 
 
541 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.24 
 
 
474 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.45 
 
 
527 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.83 
 
 
525 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.83 
 
 
528 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  50.83 
 
 
528 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  50.83 
 
 
533 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 
511 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.83 
 
 
528 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  50.83 
 
 
525 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.55 
 
 
528 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.55 
 
 
528 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  50.83 
 
 
528 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.06 
 
 
514 aa  364  2e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.19 
 
 
550 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
482 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  47.95 
 
 
656 aa  363  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.91 
 
 
590 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.48 
 
 
529 aa  360  3e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.9 
 
 
530 aa  359  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  48.51 
 
 
513 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.35 
 
 
533 aa  359  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.49 
 
 
541 aa  358  8e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  49.08 
 
 
580 aa  358  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  47.48 
 
 
530 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
546 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.18 
 
 
527 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 
571 aa  356  3.9999999999999996e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.63 
 
 
538 aa  356  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
640 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
640 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.92 
 
 
640 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
546 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
640 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.36 
 
 
583 aa  355  5.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
640 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.59 
 
 
599 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.04 
 
 
532 aa  354  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.81 
 
 
527 aa  354  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.62 
 
 
539 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.63 
 
 
532 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.34 
 
 
498 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.35 
 
 
530 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.52 
 
 
605 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.26 
 
 
610 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  47 
 
 
485 aa  350  3e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.38 
 
 
634 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.11 
 
 
611 aa  348  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.37 
 
 
485 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.37 
 
 
485 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  47.84 
 
 
637 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.84 
 
 
622 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  47.84 
 
 
623 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.17 
 
 
606 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0442  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.24 
 
 
513 aa  346  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  49.04 
 
 
574 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.84 
 
 
622 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.08 
 
 
595 aa  346  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.57 
 
 
619 aa  346  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.23 
 
 
565 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.95 
 
 
623 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.32 
 
 
543 aa  344  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.5 
 
 
457 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.17 
 
 
589 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  45.48 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.03 
 
 
528 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.21 
 
 
550 aa  339  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  46.46 
 
 
589 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  46.19 
 
 
579 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.13 
 
 
595 aa  338  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.14 
 
 
657 aa  338  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  46.43 
 
 
583 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.39 
 
 
663 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  45.18 
 
 
644 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.56 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.54 
 
 
530 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.95 
 
 
589 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.07 
 
 
609 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  47.07 
 
 
609 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  41.45 
 
 
557 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  47.08 
 
 
527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.88 
 
 
589 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1767  DEAD/DEAH box helicase-like  47.49 
 
 
540 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  47.01 
 
 
590 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  45.28 
 
 
528 aa  335  7.999999999999999e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.22 
 
 
557 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.22 
 
 
557 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.22 
 
 
557 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>