More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2833 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  77.49 
 
 		 483 aa  713    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  76.69 
 
 		 516 aa  741    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 503 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  75.1 
 
 		 478 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  76.57 
 
 		 500 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  76.71 
 
 		 487 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  88.83 
 
 		 472 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.8 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.15 
 
 		 527 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.46 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.33 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.93 
 
 		 465 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.24 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.5 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.37 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.91 
 
 		 494 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  68.28 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.53 
 
 		 521 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.35 
 
 		 482 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.18 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  62.67 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.86 
 
 		 498 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.35 
 
 		 482 aa  534  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.77 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.23 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.55 
 
 		 504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.72 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.35 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  61.11 
 
 		 518 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.49 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.92 
 
 		 503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.56 
 
 		 678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.09 
 
 		 498 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  55.21 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  52.2 
 
 		 799 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  61.54 
 
 		 644 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.8 
 
 		 555 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  55.04 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  55.9 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.32 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.94 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.58 
 
 		 513 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  45.29 
 
 		 510 aa  359  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.64 
 
 		 494 aa  359  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.04 
 
 		 497 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.76 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  48.81 
 
 		 398 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.54 
 
 		 487 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.62 
 
 		 509 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 		 491 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.87 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.87 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  45.87 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  45.87 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  45.87 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  45.87 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.61 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  45.87 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.2 
 
 		 533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  46.54 
 
 		 527 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.02 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.83 
 
 		 526 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  48.65 
 
 		 491 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.65 
 
 		 571 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.74 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.54 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.54 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.55 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.71 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  50 
 
 		 492 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  51.62 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.55 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.04 
 
 		 506 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.46 
 
 		 485 aa  349  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.74 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.02 
 
 		 550 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  42 
 
 		 495 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.52 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.88 
 
 		 482 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.72 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.49 
 
 		 626 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.82 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.33 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  48.66 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  48.79 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  47.23 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.06 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.67 
 
 		 535 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  43.51 
 
 		 557 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.34 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 		 454 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  47.86 
 
 		 527 aa  339  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  49.2 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  48.26 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.69 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.86 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.32 
 
 		 578 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>