More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4464 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  87.66 
 
 
465 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  85.93 
 
 
519 aa  857    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.85 
 
 
482 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.55 
 
 
527 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
501 aa  997    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  85.93 
 
 
519 aa  860    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.88 
 
 
484 aa  611  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  64.72 
 
 
478 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  63.15 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.94 
 
 
494 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  61.89 
 
 
516 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  66 
 
 
503 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.45 
 
 
521 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  76.68 
 
 
500 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.73 
 
 
482 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.86 
 
 
498 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.46 
 
 
505 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.53 
 
 
482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.82 
 
 
472 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.68 
 
 
499 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  62.38 
 
 
487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  69.74 
 
 
477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  76.61 
 
 
483 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.27 
 
 
462 aa  547  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.46 
 
 
504 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.94 
 
 
507 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  66.13 
 
 
518 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.13 
 
 
516 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  58.15 
 
 
493 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.95 
 
 
493 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  51 
 
 
799 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  60.53 
 
 
644 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.54 
 
 
498 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.68 
 
 
555 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.63 
 
 
678 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.29 
 
 
503 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  57.7 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  54.05 
 
 
464 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.32 
 
 
448 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.84 
 
 
484 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.6 
 
 
484 aa  364  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.02 
 
 
489 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.61 
 
 
511 aa  363  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.44 
 
 
486 aa  358  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.03 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.87 
 
 
520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  51.88 
 
 
494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.58 
 
 
515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.58 
 
 
515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  45.87 
 
 
520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.87 
 
 
520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.15 
 
 
479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.93 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.49 
 
 
403 aa  356  5e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.96 
 
 
504 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.95 
 
 
497 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.74 
 
 
482 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.81 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.91 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.47 
 
 
511 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  47.87 
 
 
527 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.84 
 
 
513 aa  353  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  45.89 
 
 
557 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.94 
 
 
487 aa  353  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.66 
 
 
571 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.32 
 
 
629 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  49.5 
 
 
491 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.48 
 
 
545 aa  350  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  47.71 
 
 
492 aa  349  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.32 
 
 
626 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  42.71 
 
 
629 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.56 
 
 
482 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.56 
 
 
482 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  44.56 
 
 
482 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  44.56 
 
 
481 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  44.56 
 
 
482 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  44.56 
 
 
482 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.16 
 
 
485 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  44.56 
 
 
559 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  51.34 
 
 
506 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.66 
 
 
540 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.68 
 
 
556 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 
525 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.12 
 
 
454 aa  347  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 
526 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 
525 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  46.93 
 
 
477 aa  346  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.95 
 
 
456 aa  346  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.27 
 
 
515 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.4 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.86 
 
 
491 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  43.82 
 
 
635 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  47.33 
 
 
398 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.28 
 
 
507 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  47.19 
 
 
622 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  43.01 
 
 
639 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.73 
 
 
493 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  44.07 
 
 
510 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  44.49 
 
 
506 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.36 
 
 
533 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>