More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3252 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
504 aa  1015    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.92 
 
 
501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.96 
 
 
484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.64 
 
 
494 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.14 
 
 
519 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.14 
 
 
519 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.2 
 
 
527 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.8 
 
 
482 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.07 
 
 
498 aa  548  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.34 
 
 
465 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.6 
 
 
537 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  57.2 
 
 
478 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  56.84 
 
 
516 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.1 
 
 
482 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  59.1 
 
 
482 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  67.61 
 
 
477 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.94 
 
 
498 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  65.57 
 
 
500 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.49 
 
 
505 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.06 
 
 
499 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.05 
 
 
507 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.29 
 
 
521 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  66.94 
 
 
516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  69.52 
 
 
644 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  55.86 
 
 
503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  67.56 
 
 
483 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.88 
 
 
493 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.95 
 
 
472 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  56.16 
 
 
487 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  66.58 
 
 
518 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.58 
 
 
516 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  58.54 
 
 
493 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.71 
 
 
462 aa  499  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  62.44 
 
 
458 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.48 
 
 
678 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  58.02 
 
 
799 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.98 
 
 
503 aa  482  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.77 
 
 
555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.16 
 
 
448 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  58.57 
 
 
464 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.43 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.74 
 
 
509 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  55.01 
 
 
491 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.74 
 
 
497 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.74 
 
 
511 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.74 
 
 
520 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  54.74 
 
 
520 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.47 
 
 
482 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.74 
 
 
520 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.25 
 
 
482 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  54.25 
 
 
482 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  54.25 
 
 
559 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  54.74 
 
 
527 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.97 
 
 
571 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  54.25 
 
 
482 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  54.25 
 
 
482 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.25 
 
 
482 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  54.25 
 
 
481 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.27 
 
 
493 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.49 
 
 
556 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.11 
 
 
537 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  46.76 
 
 
510 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.27 
 
 
493 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  50.82 
 
 
494 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 
504 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  51.86 
 
 
495 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
479 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  50.65 
 
 
579 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 
571 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.94 
 
 
545 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.35 
 
 
485 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.35 
 
 
485 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.35 
 
 
485 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 
486 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  50.39 
 
 
477 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  51.35 
 
 
485 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.35 
 
 
485 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  51.62 
 
 
484 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  49.45 
 
 
398 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.06 
 
 
485 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50 
 
 
515 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50 
 
 
515 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.64 
 
 
479 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  51.48 
 
 
543 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.73 
 
 
578 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 
494 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.49 
 
 
462 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  51.62 
 
 
486 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
479 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.99 
 
 
489 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 
480 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 
577 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 
486 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.41 
 
 
486 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.39 
 
 
482 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.76 
 
 
456 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.12 
 
 
460 aa  365  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
480 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.49 
 
 
454 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.49 
 
 
454 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>