More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0938 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.87 
 
 
505 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  87.04 
 
 
498 aa  831    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
482 aa  980    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  65.96 
 
 
516 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.93 
 
 
499 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.46 
 
 
462 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  74.02 
 
 
477 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.69 
 
 
521 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  99.79 
 
 
482 aa  978    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.58 
 
 
519 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.58 
 
 
519 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.35 
 
 
501 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.83 
 
 
484 aa  597  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.31 
 
 
527 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.14 
 
 
482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  74.34 
 
 
465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.3 
 
 
494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.52 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  68.58 
 
 
478 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.55 
 
 
472 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  68.64 
 
 
516 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  69.59 
 
 
503 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  69.33 
 
 
500 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.04 
 
 
504 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  70.7 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  66.75 
 
 
487 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  63.08 
 
 
518 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.67 
 
 
507 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.84 
 
 
516 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  62.03 
 
 
644 aa  498  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.19 
 
 
493 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  58.17 
 
 
493 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.53 
 
 
498 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.77 
 
 
678 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.86 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.65 
 
 
458 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.01 
 
 
555 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  47.17 
 
 
799 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  51.79 
 
 
464 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.6 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.7 
 
 
486 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.76 
 
 
489 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
489 aa  348  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.68 
 
 
571 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  49.61 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.61 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.61 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  49.61 
 
 
559 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  49.61 
 
 
481 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.88 
 
 
454 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  47.75 
 
 
491 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  49.61 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  49.61 
 
 
482 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 
482 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  47.99 
 
 
494 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
509 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.84 
 
 
520 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  48.84 
 
 
520 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 
487 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.84 
 
 
520 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.69 
 
 
504 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  49.6 
 
 
492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.82 
 
 
556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  48.38 
 
 
527 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.33 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.45 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.44 
 
 
513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.45 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  48.93 
 
 
510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.28 
 
 
473 aa  336  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.8 
 
 
493 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48 
 
 
537 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.92 
 
 
450 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.89 
 
 
628 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
626 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  48.53 
 
 
495 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.36 
 
 
522 aa  333  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.53 
 
 
493 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.11 
 
 
511 aa  333  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.24 
 
 
460 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.05 
 
 
491 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  48.66 
 
 
452 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  47.99 
 
 
506 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  45.43 
 
 
460 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  43.12 
 
 
426 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.48 
 
 
479 aa  330  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 
485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.15 
 
 
494 aa  329  6e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.86 
 
 
439 aa  329  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.31 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.23 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  44.29 
 
 
557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  49.05 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.12 
 
 
578 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  44.61 
 
 
629 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  41.79 
 
 
472 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.66 
 
 
506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>