More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0856 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
503 aa  1008    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.31 
 
 
555 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  61.97 
 
 
799 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.51 
 
 
484 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.49 
 
 
519 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.29 
 
 
519 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  66.12 
 
 
478 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.67 
 
 
501 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.02 
 
 
465 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.83 
 
 
527 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  56.93 
 
 
516 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.86 
 
 
494 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.21 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.58 
 
 
537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  64.58 
 
 
500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.62 
 
 
499 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.23 
 
 
504 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  63.21 
 
 
503 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.26 
 
 
458 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.56 
 
 
482 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.92 
 
 
521 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.61 
 
 
472 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.2 
 
 
505 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.56 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.47 
 
 
493 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  54.68 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.61 
 
 
498 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.62 
 
 
498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  63.2 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  62.44 
 
 
487 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  51.37 
 
 
516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  61.7 
 
 
518 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  61.11 
 
 
644 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.7 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
462 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.64 
 
 
507 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  51.65 
 
 
493 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  54.41 
 
 
464 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.01 
 
 
448 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.52 
 
 
678 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.12 
 
 
489 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 
491 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.06 
 
 
482 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.12 
 
 
487 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.29 
 
 
578 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.91 
 
 
485 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.77 
 
 
511 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 
513 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.13 
 
 
522 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  51.26 
 
 
491 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.54 
 
 
484 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.31 
 
 
484 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
494 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.49 
 
 
489 aa  363  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.05 
 
 
525 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  50.65 
 
 
559 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.47 
 
 
482 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  51.47 
 
 
482 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  51.47 
 
 
482 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  51.47 
 
 
482 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.47 
 
 
482 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  51.47 
 
 
481 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 
511 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.37 
 
 
486 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  48.73 
 
 
492 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.54 
 
 
486 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.39 
 
 
571 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.9 
 
 
497 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.47 
 
 
437 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.2 
 
 
550 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
525 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.4 
 
 
535 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.86 
 
 
533 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  48.54 
 
 
527 aa  360  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 
526 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 
509 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 
515 aa  359  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.94 
 
 
549 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.2 
 
 
549 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.28 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  49.34 
 
 
527 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
545 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.03 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
504 aa  357  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  48.94 
 
 
429 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.88 
 
 
418 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.61 
 
 
520 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  49.61 
 
 
520 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.61 
 
 
520 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  47.34 
 
 
435 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  49.35 
 
 
537 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.49 
 
 
577 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.49 
 
 
578 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.39 
 
 
418 aa  352  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.51 
 
 
540 aa  352  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.1 
 
 
418 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  45.35 
 
 
445 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  44.39 
 
 
495 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.82 
 
 
477 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.56 
 
 
480 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>