More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1052 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
535 aa  1078    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  99.81 
 
 
535 aa  1074    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  87.12 
 
 
464 aa  765    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  66.74 
 
 
460 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.1 
 
 
471 aa  514  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.77 
 
 
448 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  48.42 
 
 
469 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.62 
 
 
439 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  47.97 
 
 
491 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.71 
 
 
437 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.22 
 
 
453 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  45.93 
 
 
477 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.25 
 
 
497 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.76 
 
 
461 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.26 
 
 
474 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  45.76 
 
 
461 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.44 
 
 
479 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 
630 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.11 
 
 
479 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.85 
 
 
506 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  45.79 
 
 
446 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.32 
 
 
510 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.32 
 
 
510 aa  365  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.37 
 
 
459 aa  365  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.88 
 
 
499 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.33 
 
 
626 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.88 
 
 
452 aa  363  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.6 
 
 
626 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.6 
 
 
627 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 
567 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  51.23 
 
 
434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  48.12 
 
 
498 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.47 
 
 
485 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.06 
 
 
506 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.56 
 
 
415 aa  360  4e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  50 
 
 
481 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50 
 
 
482 aa  360  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.98 
 
 
506 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.55 
 
 
580 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.64 
 
 
492 aa  359  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  45.58 
 
 
639 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.62 
 
 
485 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  49.62 
 
 
485 aa  359  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  49.62 
 
 
485 aa  358  9e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  49.07 
 
 
557 aa  359  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  44.64 
 
 
635 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.68 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  49.62 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.48 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  49.49 
 
 
482 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  49.62 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  49.05 
 
 
579 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  50.95 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.95 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  50.95 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.96 
 
 
628 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.95 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  42.96 
 
 
424 aa  357  3.9999999999999996e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.41 
 
 
506 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.75 
 
 
448 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.77 
 
 
418 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  46.49 
 
 
476 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.92 
 
 
476 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.11 
 
 
479 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  48.8 
 
 
622 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.68 
 
 
454 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.68 
 
 
454 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.11 
 
 
480 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.5 
 
 
426 aa  355  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.25 
 
 
488 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  48.27 
 
 
629 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.12 
 
 
601 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.27 
 
 
629 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  49.74 
 
 
484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  48.26 
 
 
574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  46.3 
 
 
418 aa  353  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.35 
 
 
456 aa  353  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  45.05 
 
 
445 aa  353  5e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  46.88 
 
 
420 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.41 
 
 
515 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.24 
 
 
571 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.88 
 
 
411 aa  352  8e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.97 
 
 
486 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.93 
 
 
498 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.84 
 
 
452 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  48.97 
 
 
486 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.97 
 
 
486 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  45.01 
 
 
540 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
599 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0115  DEAD/DEAH box helicase-like  49.11 
 
 
451 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.19 
 
 
463 aa  351  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.22 
 
 
455 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>