More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6484 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.71 
 
 		 510 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  85.21 
 
 		 506 aa  816    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 499 aa  991    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.85 
 
 		 506 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.9 
 
 		 510 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  82.81 
 
 		 506 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.11 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  59.56 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  57.83 
 
 		 498 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  55.86 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.52 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  64.71 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  63.71 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  54.47 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.41 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  55.19 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  52.89 
 
 		 476 aa  478  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.74 
 
 		 453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.07 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.24 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.4 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.39 
 
 		 492 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.99 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  51.57 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.77 
 
 		 525 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.61 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.57 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.44 
 
 		 513 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.45 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.96 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.8 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.21 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.82 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.81 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  55.98 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.38 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.75 
 
 		 511 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.95 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.65 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  49.57 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.64 
 
 		 418 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.04 
 
 		 418 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  49.79 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.59 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.73 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.4 
 
 		 567 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.58 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.07 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  46.02 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.39 
 
 		 580 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  51.62 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.5 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.09 
 
 		 628 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.78 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.5 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.69 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  53.33 
 
 		 574 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.86 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.86 
 
 		 526 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.97 
 
 		 565 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.93 
 
 		 525 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.23 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.27 
 
 		 578 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.17 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.17 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.8 
 
 		 425 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  53.17 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.17 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.45 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.45 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.32 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.2 
 
 		 601 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.74 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.17 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1595  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.62 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000842121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  50.68 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.59 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.97 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.68 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.52 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.71 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.5 
 
 		 626 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  53.7 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.94 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  49.53 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.42 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  48.22 
 
 		 635 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.52 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  46.41 
 
 		 639 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.7 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.91 
 
 		 482 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.77 
 
 		 426 aa  392  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>