More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1778 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 479 aa  959    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.34 
 
 		 448 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.93 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.86 
 
 		 499 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.56 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.89 
 
 		 506 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.1 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.43 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.43 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.43 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  50.83 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.23 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  50.76 
 
 		 476 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  50.11 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.99 
 
 		 525 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.89 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  50.54 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  56.38 
 
 		 481 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  56.76 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.13 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.19 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  57.26 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.57 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.97 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.96 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.32 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.8 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.59 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  51.02 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.21 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.49 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.96 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  53.12 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.84 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.73 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.69 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.76 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.36 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.73 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.16 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.45 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  52.91 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.04 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.26 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  51.63 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.09 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.83 
 
 		 567 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.04 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.42 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  53.35 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.05 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  51.77 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.09 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  47.69 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.94 
 
 		 560 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.39 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.39 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  49.32 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.43 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.91 
 
 		 469 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.39 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.16 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.43 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  52.69 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.43 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1595  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.39 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000842121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  46.14 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.67 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.13 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.67 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  53.15 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  52.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.67 
 
 		 581 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.24 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.8 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.48 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.39 
 
 		 549 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.46 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.39 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.27 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  51.37 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.08 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  49.6 
 
 		 574 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.04 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1851  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.36 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>