More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2582 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
427 aa  862    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.15 
 
 
423 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.84 
 
 
439 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.22 
 
 
510 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.22 
 
 
506 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.22 
 
 
510 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.97 
 
 
485 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.94 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.57 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.67 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.87 
 
 
479 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.66 
 
 
383 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.17 
 
 
506 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.73 
 
 
499 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.6 
 
 
463 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.02 
 
 
559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.87 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  46.7 
 
 
446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  50.37 
 
 
418 aa  402  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  53.68 
 
 
491 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.33 
 
 
415 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  53.92 
 
 
482 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.87 
 
 
474 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.12 
 
 
418 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.05 
 
 
418 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.03 
 
 
437 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.88 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  55.5 
 
 
469 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.43 
 
 
448 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  54.82 
 
 
498 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.4 
 
 
418 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.88 
 
 
418 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  54.69 
 
 
476 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  53.03 
 
 
481 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  54.19 
 
 
477 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.23 
 
 
497 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.02 
 
 
452 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.71 
 
 
525 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1595  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.96 
 
 
428 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000842121  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  47.48 
 
 
424 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.59 
 
 
514 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.14 
 
 
599 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.26 
 
 
577 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.26 
 
 
578 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  48.04 
 
 
574 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.91 
 
 
459 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.77 
 
 
598 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.89 
 
 
453 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  50.25 
 
 
477 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.87 
 
 
601 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.23 
 
 
441 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.86 
 
 
494 aa  364  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  50.27 
 
 
579 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.21 
 
 
496 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.58 
 
 
491 aa  362  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  49.73 
 
 
484 aa  362  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.86 
 
 
567 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.06 
 
 
581 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.76 
 
 
485 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.76 
 
 
485 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  51.76 
 
 
485 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.76 
 
 
485 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.14 
 
 
580 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.76 
 
 
485 aa  359  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  48.81 
 
 
393 aa  358  7e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.14 
 
 
565 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  47.03 
 
 
557 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.14 
 
 
560 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  45.77 
 
 
639 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.49 
 
 
482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.54 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  45.97 
 
 
635 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.91 
 
 
525 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.91 
 
 
525 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.91 
 
 
526 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.2 
 
 
426 aa  356  5e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.49 
 
 
456 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.98 
 
 
550 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.34 
 
 
488 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.73 
 
 
626 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.68 
 
 
626 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.77 
 
 
515 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 
627 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  52.01 
 
 
540 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.63 
 
 
511 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.71 
 
 
535 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.35 
 
 
513 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.45 
 
 
630 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.09 
 
 
522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.22 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.3 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.22 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  46.3 
 
 
461 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.06 
 
 
443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  50.95 
 
 
484 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.41 
 
 
515 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.41 
 
 
515 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 
486 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 
486 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>