More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1915 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  100 
 
 		 393 aa  788    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.44 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.05 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.33 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.45 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.79 
 
 		 437 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.45 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.95 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.52 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.73 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.96 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.17 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.22 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.88 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.89 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.88 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.76 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  53.07 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.02 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.48 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.14 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  54.05 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.91 
 
 		 463 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.27 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.59 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.63 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.69 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.78 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.85 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  53.64 
 
 		 482 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  53.37 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  51.82 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.28 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.35 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  52.29 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  53.64 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.75 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.79 
 
 		 578 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.79 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  53.76 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.69 
 
 		 628 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.47 
 
 		 535 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  54.59 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.53 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  52.32 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.53 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.53 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.2 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 		 515 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.66 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.33 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.49 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0304  hypothetical protein  52.49 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.77 
 
 		 491 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  50.65 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  52.15 
 
 		 629 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  52.47 
 
 		 445 aa  362  9e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.15 
 
 		 629 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.63 
 
 		 511 aa  361  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.9 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.33 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  51.88 
 
 		 622 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  51.76 
 
 		 460 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.85 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.19 
 
 		 513 aa  358  9e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.47 
 
 		 418 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.47 
 
 		 418 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.42 
 
 		 453 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  52.23 
 
 		 414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.61 
 
 		 626 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.79 
 
 		 477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.43 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.31 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.7 
 
 		 464 aa  355  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.14 
 
 		 626 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.25 
 
 		 522 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.85 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.85 
 
 		 453 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.85 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.14 
 
 		 627 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.85 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.85 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  52.57 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.57 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.57 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  52.57 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.57 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.57 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.57 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 		 630 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.12 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.12 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.12 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  51.34 
 
 		 557 aa  352  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  53.12 
 
 		 485 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  53.12 
 
 		 485 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.3 
 
 		 454 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 		 426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 		 423 aa  352  8e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.3 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>