More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0115 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0115  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 451 aa  908    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.12 
 
 		 580 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  56.64 
 
 		 484 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.03 
 
 		 498 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.44 
 
 		 567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.31 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.51 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  55.51 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  61.25 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  61.66 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.36 
 
 		 479 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  46.99 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.37 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.45 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.37 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.08 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.96 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  47.37 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  46.5 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.26 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.85 
 
 		 506 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.36 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.65 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.07 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  43.88 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.54 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.11 
 
 		 535 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.11 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.39 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.38 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  49.48 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  48.08 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  44.37 
 
 		 476 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  47.97 
 
 		 481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.29 
 
 		 511 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.54 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.43 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 		 626 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.22 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.61 
 
 		 497 aa  356  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.52 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.18 
 
 		 533 aa  352  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  43.07 
 
 		 639 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.91 
 
 		 479 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.98 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.98 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.64 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.62 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  42.86 
 
 		 635 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.05 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.67 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.3 
 
 		 601 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.18 
 
 		 466 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  48.07 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.07 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.67 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.07 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.07 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.99 
 
 		 628 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.55 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.07 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  48.07 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.07 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.67 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.67 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.67 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.07 
 
 		 454 aa  347  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.67 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.98 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.75 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.1 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.83 
 
 		 462 aa  345  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  47.76 
 
 		 516 aa  345  7e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.34 
 
 		 418 aa  345  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.63 
 
 		 627 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 		 630 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.71 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  44.02 
 
 		 540 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.81 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.9 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  47.55 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  44.02 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.5 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.72 
 
 		 491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46 
 
 		 448 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.11 
 
 		 599 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.68 
 
 		 477 aa  342  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.61 
 
 		 485 aa  342  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.86 
 
 		 455 aa  341  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.63 
 
 		 418 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  44.24 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  42.47 
 
 		 557 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.87 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  43.9 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  48.91 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.42 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.85 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.03 
 
 		 577 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.28 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.03 
 
 		 578 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>