More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000199 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  90.87 
 
 
421 aa  779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
419 aa  855    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.26 
 
 
422 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0429  putative ATP-dependent RNA helicase 1  63.16 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.49 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.69 
 
 
435 aa  411  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 
432 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.94 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  49.15 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.94 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  51.94 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.94 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3027  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.44 
 
 
414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  49.15 
 
 
411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.63 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.33 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  51.94 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.46 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
486 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  51 
 
 
540 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0042  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.72 
 
 
420 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.39 
 
 
438 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  51.94 
 
 
484 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  54.23 
 
 
445 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.94 
 
 
482 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  51.65 
 
 
543 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.53 
 
 
433 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  51.94 
 
 
486 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
480 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.79 
 
 
413 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134965  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
486 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  51.41 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.41 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.41 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  51.41 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  51.69 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001506  ATP-dependent RNA helicase  49.25 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000291883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.58 
 
 
432 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.37 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.14 
 
 
560 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.28 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.41 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.14 
 
 
565 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.33 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.12 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.99 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.41 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.41 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.33 
 
 
433 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.16 
 
 
454 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3388  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.02 
 
 
409 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.81 
 
 
453 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.34 
 
 
433 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.15 
 
 
515 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.81 
 
 
453 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  49.52 
 
 
426 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.16 
 
 
454 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.81 
 
 
453 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 
433 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1330  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.78 
 
 
411 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 
433 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.81 
 
 
453 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.53 
 
 
471 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.02 
 
 
411 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 
433 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.81 
 
 
453 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
433 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1296  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.29 
 
 
411 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3058  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.54 
 
 
412 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.93 
 
 
455 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.03 
 
 
522 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.54 
 
 
456 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1312  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  46.73 
 
 
434 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  47.69 
 
 
510 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.47 
 
 
451 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3364  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.11 
 
 
419 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.75 
 
 
494 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.01 
 
 
452 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.14 
 
 
540 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05443  ATP-dependent RNA helicase  48.25 
 
 
430 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.47 
 
 
451 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.31 
 
 
409 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 
409 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 
409 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  52.27 
 
 
473 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.52 
 
 
533 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.75 
 
 
492 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.58 
 
 
476 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.88 
 
 
491 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  52.58 
 
 
477 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  52.52 
 
 
435 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.2 
 
 
436 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48 
 
 
471 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 
426 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.53 
 
 
443 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00424195  normal  0.0145877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>