More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3701 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
467 aa  937    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.64 
 
 
450 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.32 
 
 
439 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  60.63 
 
 
447 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.58 
 
 
447 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  65.81 
 
 
451 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.93 
 
 
447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  63.94 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.89 
 
 
471 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.99 
 
 
453 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.45 
 
 
425 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.01 
 
 
560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_172  hypothetical protein  54.73 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000114775  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.5 
 
 
403 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.96 
 
 
462 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1998  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.03 
 
 
444 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.73 
 
 
561 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2480  DEAD/DEAH box helicase-like  53.05 
 
 
530 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.045241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  47.46 
 
 
460 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.08 
 
 
571 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.27 
 
 
489 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
403 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  48.28 
 
 
579 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2025  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.74 
 
 
400 aa  361  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.28 
 
 
494 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  48.81 
 
 
543 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.74 
 
 
549 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.51 
 
 
525 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.33 
 
 
578 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.31 
 
 
525 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  49.73 
 
 
491 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.31 
 
 
526 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.28 
 
 
522 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.72 
 
 
549 aa  358  9e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  48.56 
 
 
484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  43.91 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.28 
 
 
515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  48.28 
 
 
453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
479 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.64 
 
 
513 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.67 
 
 
514 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  45.43 
 
 
510 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.54 
 
 
515 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
486 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.83 
 
 
535 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  48.41 
 
 
486 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.26 
 
 
477 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
486 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  48.15 
 
 
482 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.86 
 
 
482 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.4 
 
 
540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.09 
 
 
601 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  47.09 
 
 
574 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.48 
 
 
452 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.32 
 
 
511 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0943  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 
409 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
480 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.28 
 
 
506 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.88 
 
 
485 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  45.79 
 
 
540 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.88 
 
 
485 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.88 
 
 
485 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  47.88 
 
 
485 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
520 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  49.47 
 
 
520 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.04 
 
 
491 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.88 
 
 
485 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
520 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.1 
 
 
565 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.2 
 
 
482 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  49.2 
 
 
559 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.2 
 
 
482 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
511 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  49.2 
 
 
482 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  49.2 
 
 
482 aa  351  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  49.2 
 
 
482 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  49.2 
 
 
481 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
497 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 
509 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.2 
 
 
571 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.13 
 
 
550 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  48.93 
 
 
527 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.49 
 
 
496 aa  349  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.1 
 
 
560 aa  349  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.54 
 
 
471 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.23 
 
 
545 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.77 
 
 
577 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.51 
 
 
488 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.77 
 
 
578 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.4 
 
 
599 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  48.63 
 
 
473 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.48 
 
 
453 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.48 
 
 
453 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.48 
 
 
453 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.48 
 
 
453 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.48 
 
 
453 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.52 
 
 
522 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.05 
 
 
462 aa  342  8e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  39.5 
 
 
527 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>