223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5300 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  100 
 
 		 449 aa  931    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  90.65 
 
 		 451 aa  845    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  91.54 
 
 		 449 aa  833    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  91.98 
 
 		 451 aa  835    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  87.17 
 
 		 374 aa  675    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  95.55 
 
 		 449 aa  867    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  90.65 
 
 		 449 aa  846    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  90.87 
 
 		 449 aa  846    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  82.85 
 
 		 450 aa  766    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  70.18 
 
 		 449 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  87.17 
 
 		 374 aa  669    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  56.97 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  52.8 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  37.91 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  35.75 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  37.99 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  39.24 
 
 		 426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  36.45 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  35.96 
 
 		 453 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  33.91 
 
 		 623 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  34.76 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  32.48 
 
 		 716 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.1 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  24.15 
 
 		 1158 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  20.6 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  23.84 
 
 		 1158 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1169 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  23.81 
 
 		 1168 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  22.47 
 
 		 730 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  24.09 
 
 		 1202 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  24.41 
 
 		 1211 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1178 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  22.89 
 
 		 1177 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  23.45 
 
 		 1126 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  26.4 
 
 		 1169 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  23.26 
 
 		 1121 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  26.67 
 
 		 765 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  22.55 
 
 		 1188 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  24.44 
 
 		 1109 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  24.61 
 
 		 1224 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1188 aa  53.1  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  23.58 
 
 		 1176 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  25 
 
 		 801 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  23.43 
 
 		 1127 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.52 
 
 		 688 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  23.08 
 
 		 1177 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  24.73 
 
 		 725 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  23.28 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30585  predicted protein  26.98 
 
 		 942 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  24.17 
 
 		 678 aa  52.4  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  25.66 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  23.35 
 
 		 1192 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.33 
 
 		 675 aa  52.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  24.18 
 
 		 1112 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.41 
 
 		 1166 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3302  primosome assembly protein PriA  25.45 
 
 		 768 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.304002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.4 
 
 		 671 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1168 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  22.48 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  21.29 
 
 		 725 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  24.27 
 
 		 1180 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  21.38 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  25.74 
 
 		 1168 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  21.29 
 
 		 725 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  23.03 
 
 		 1116 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  23.05 
 
 		 1192 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  25.83 
 
 		 735 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 805 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0824  ATP-dependent DNA helicase RecG  19.94 
 
 		 673 aa  50.4  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0309  excinuclease ABC subunit B  31.71 
 
 		 660 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00254602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  24.89 
 
 		 734 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  23.77 
 
 		 1161 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1123 aa  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  22.09 
 
 		 804 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  21.75 
 
 		 1099 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  22.88 
 
 		 768 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  24.2 
 
 		 730 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4366  primosomal protein N'  23.6 
 
 		 736 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4789  primosome assembly protein PriA  24.73 
 
 		 731 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3490  primosome assembly protein PriA  24.16 
 
 		 764 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000105942  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.41 
 
 		 712 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  22.47 
 
 		 1167 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  22.46 
 
 		 832 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  24.86 
 
 		 731 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  25 
 
 		 734 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  22.47 
 
 		 1167 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3341  primosome assembly protein PriA  23.6 
 
 		 761 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000327838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4099  primosome assembly protein PriA  24.73 
 
 		 732 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  32.35 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  23.08 
 
 		 813 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3812  primosome assembly protein PriA  24.73 
 
 		 732 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>