More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4755 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  100 
 
 		 623 aa  1279    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 450 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  36.85 
 
 		 499 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  33.91 
 
 		 449 aa  253  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  34.35 
 
 		 449 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  34.13 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  33.69 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  33.12 
 
 		 449 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  36.71 
 
 		 453 aa  252  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  33.7 
 
 		 449 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  35.56 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  33.26 
 
 		 451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  33.26 
 
 		 449 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  38.32 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  38.69 
 
 		 374 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  33.74 
 
 		 426 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  30.84 
 
 		 429 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  30.35 
 
 		 716 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  29.37 
 
 		 425 aa  203  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  30.72 
 
 		 439 aa  203  9e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  31.22 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.55 
 
 		 675 aa  79  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1263  helicase domain protein  25.65 
 
 		 626 aa  67  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.429277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.4 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.99 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  26.18 
 
 		 1169 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  24.75 
 
 		 1169 aa  64.7  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.48 
 
 		 678 aa  64.3  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.28 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  26.14 
 
 		 1170 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  23.15 
 
 		 1207 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  25.08 
 
 		 1155 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  24.63 
 
 		 1265 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  25.33 
 
 		 1174 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  28.35 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0469  transcription-repair coupling factor  25.3 
 
 		 986 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  24.18 
 
 		 1168 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  24.13 
 
 		 1162 aa  61.6  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  24.18 
 
 		 1168 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  25.39 
 
 		 1224 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.57 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  25.22 
 
 		 1246 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  24.76 
 
 		 1169 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.53 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  23.17 
 
 		 1188 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.36 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.96 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.96 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  23.81 
 
 		 1162 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  25.44 
 
 		 1188 aa  60.1  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.39 
 
 		 685 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  23.64 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.17 
 
 		 686 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  24.67 
 
 		 1167 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  24.67 
 
 		 1167 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  25.4 
 
 		 1180 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  25.49 
 
 		 1165 aa  58.9  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  25.15 
 
 		 1179 aa  58.9  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.99 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  24.4 
 
 		 1177 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  25.83 
 
 		 1195 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  24.48 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.51 
 
 		 704 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  25.95 
 
 		 1179 aa  57.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  25 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.84 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  25 
 
 		 701 aa  57.4  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  24.43 
 
 		 1175 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2623N  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.24 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.02 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.47 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  23.85 
 
 		 1153 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1177 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.75 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1281  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.75 
 
 		 695 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  23.38 
 
 		 1168 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.45 
 
 		 729 aa  57  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  22.57 
 
 		 981 aa  56.6  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  22.73 
 
 		 1173 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0765  transcription-repair coupling factor  24.3 
 
 		 1128 aa  56.6  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.267338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  24.26 
 
 		 1178 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.32 
 
 		 893 aa  57  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  23.81 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.03 
 
 		 901 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1485  transcription-repair coupling factor  23.77 
 
 		 1172 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  23.87 
 
 		 1174 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0737  transcription-repair coupling factor  24.39 
 
 		 985 aa  57  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00351961  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  22.73 
 
 		 1150 aa  56.2  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.48 
 
 		 704 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  23.73 
 
 		 1153 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.11 
 
 		 706 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.41 
 
 		 696 aa  56.2  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  23.17 
 
 		 1166 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  24.42 
 
 		 1147 aa  55.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  22.04 
 
 		 1155 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  25.93 
 
 		 1211 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  23.67 
 
 		 1182 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>