More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0469 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1228  transcription-repair coupling factor  57.83 
 
 		 978 aa  1087    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0638  transcription-repair coupling factor  58.13 
 
 		 978 aa  1089    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1103  transcription-repair coupling factor  58.13 
 
 		 978 aa  1093    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1566  transcription-repair coupling factor  49.5 
 
 		 990 aa  932    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  62.77 
 
 		 981 aa  1269    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1039  transcription-repair coupling factor  59.82 
 
 		 979 aa  1141    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.113966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0078  transcription-repair coupling factor  61.95 
 
 		 981 aa  1233    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1613  transcription-repair coupling factor  50.56 
 
 		 989 aa  974    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0469  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 986 aa  1979    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0737  transcription-repair coupling factor  60.94 
 
 		 985 aa  1205    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00351961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  39.48 
 
 		 1158 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  42.29 
 
 		 1164 aa  512  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  43.31 
 
 		 1157 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  37.69 
 
 		 1150 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1160 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1160 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1160 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1157 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  42.24 
 
 		 1143 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1178 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  41 
 
 		 1173 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1159 aa  505  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  42.29 
 
 		 1162 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  42.62 
 
 		 1160 aa  505  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  42.45 
 
 		 1157 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  41.01 
 
 		 1153 aa  497  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  37.15 
 
 		 1157 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  38.21 
 
 		 1149 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  39.5 
 
 		 1155 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1271 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  31.63 
 
 		 1103 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  38.71 
 
 		 1177 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  39.01 
 
 		 1158 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  37.2 
 
 		 1157 aa  492  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  41.83 
 
 		 1153 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1758  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 		 923 aa  491  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0298982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  39.82 
 
 		 1149 aa  492  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1153 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1148 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  38.63 
 
 		 1157 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1952  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1162 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00516748  normal  0.328047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  39.4 
 
 		 1207 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  39.07 
 
 		 1150 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  39.14 
 
 		 1149 aa  489  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  40.42 
 
 		 1159 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2395  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1162 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000829473  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  40.17 
 
 		 1151 aa  489  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  39.91 
 
 		 1179 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  40.81 
 
 		 1162 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  38.62 
 
 		 1148 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  40.49 
 
 		 1145 aa  489  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  39.87 
 
 		 1157 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2511  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1165 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00100471  normal  0.47703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1162 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1155 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1164 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1148 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  42.04 
 
 		 1153 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  42.04 
 
 		 1153 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1195  transcription-repair coupling factor  40.5 
 
 		 1157 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.865219  normal  0.466133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  39.33 
 
 		 1150 aa  485  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1164 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  38.88 
 
 		 1171 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  39.77 
 
 		 1176 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  40.49 
 
 		 1162 aa  486  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1148 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1163 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  39.6 
 
 		 1149 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1148 aa  482  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  39.17 
 
 		 1150 aa  482  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  40.68 
 
 		 1150 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  38.87 
 
 		 1150 aa  482  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  39.6 
 
 		 1149 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  40.16 
 
 		 1141 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1160 aa  482  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1327  transcription-repair coupling factor  40.42 
 
 		 1156 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241535  hitchhiker  0.000253034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  39.44 
 
 		 1165 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1164 aa  482  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2088  transcription-repair coupling factor  40.78 
 
 		 1217 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1148 aa  482  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1617  transcription-repair coupling factor  38.96 
 
 		 1147 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.89425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1988  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1157 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2848  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1164 aa  478  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.420758  normal  0.818462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1360  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1150 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2513  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1260  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2359  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.741078  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3318  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.101121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  40.42 
 
 		 1185 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  40.78 
 
 		 1156 aa  479  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2402  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1189 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>