More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1613 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1228  transcription-repair coupling factor  52.83 
 
 		 978 aa  991    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1613  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 989 aa  2019    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1103  transcription-repair coupling factor  52.73 
 
 		 978 aa  989    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1566  transcription-repair coupling factor  53.97 
 
 		 990 aa  1051    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1039  transcription-repair coupling factor  52.77 
 
 		 979 aa  987    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.113966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0078  transcription-repair coupling factor  52.13 
 
 		 981 aa  1000    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0638  transcription-repair coupling factor  52.94 
 
 		 978 aa  986    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0737  transcription-repair coupling factor  53.48 
 
 		 985 aa  1023    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00351961  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  53.25 
 
 		 981 aa  1023    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0469  transcription-repair coupling factor  50.56 
 
 		 986 aa  962    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  32.88 
 
 		 1165 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.26 
 
 		 1177 aa  509  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  40.85 
 
 		 1157 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  41.25 
 
 		 1158 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  41.69 
 
 		 1159 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  41.43 
 
 		 1157 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1178 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  40.35 
 
 		 1157 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  40.56 
 
 		 1123 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  43.78 
 
 		 1164 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  40.06 
 
 		 1160 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  39.58 
 
 		 1160 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0894  transcription-repair coupling factor  42.81 
 
 		 1173 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180496  normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  41.2 
 
 		 1157 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  41.21 
 
 		 1207 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  40.73 
 
 		 1164 aa  499  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1656  transcription-repair coupling factor  41.72 
 
 		 1146 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1157 aa  499  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1162 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  39.58 
 
 		 1160 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  39.58 
 
 		 1160 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1155 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  41.71 
 
 		 1149 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  41.57 
 
 		 1157 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  39.5 
 
 		 1197 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1162 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  40.69 
 
 		 1143 aa  495  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  41.68 
 
 		 1153 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  41.68 
 
 		 1153 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1965  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1147 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550833  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1178 aa  492  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  40.42 
 
 		 1173 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  42.07 
 
 		 1153 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.48 
 
 		 1176 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  41.14 
 
 		 1198 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  39.48 
 
 		 1157 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1178 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  39.67 
 
 		 1157 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  39.45 
 
 		 1157 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.9 
 
 		 1183 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4262  transcription-repair coupling factor  41.77 
 
 		 1168 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  39.8 
 
 		 1150 aa  489  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2220  transcription-repair coupling factor  40.42 
 
 		 1157 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  40.07 
 
 		 1162 aa  489  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  39.81 
 
 		 1176 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  42.11 
 
 		 1167 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1145 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1148 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1157 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  41.21 
 
 		 1153 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2006  transcription-repair coupling factor  37.56 
 
 		 1155 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000316908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  40.73 
 
 		 1150 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1360  transcription-repair coupling factor  41.5 
 
 		 1150 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  37.34 
 
 		 1160 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1149 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6308  transcription-repair coupling factor  39.62 
 
 		 1203 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  32.91 
 
 		 1059 aa  486  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1569  transcription-repair coupling factor  37.61 
 
 		 1184 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.878317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1155 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  39.26 
 
 		 1165 aa  485  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1754  transcription-repair coupling factor  41.99 
 
 		 1144 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.430393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1179 aa  486  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1968  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1156 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.095546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1955  transcription-repair coupling factor  41.17 
 
 		 1150 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  39.61 
 
 		 1165 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1653  transcription-repair coupling factor  38.6 
 
 		 1194 aa  485  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1156 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.67 
 
 		 1170 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1185 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  40.82 
 
 		 1148 aa  485  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  41.01 
 
 		 1271 aa  485  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1859  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1156 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0201793  hitchhiker  0.000194707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.15 
 
 		 1165 aa  484  1e-135  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1156 aa  485  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  40.71 
 
 		 1156 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  41.36 
 
 		 1189 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  42.43 
 
 		 1200 aa  482  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  39.74 
 
 		 1150 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2395  transcription-repair coupling factor  39.73 
 
 		 1162 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000829473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  40.13 
 
 		 1160 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>