More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0737 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1228  transcription-repair coupling factor  57.93 
 
 		 978 aa  1098    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0469  transcription-repair coupling factor  60.94 
 
 		 986 aa  1191    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1613  transcription-repair coupling factor  53.48 
 
 		 989 aa  1018    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1103  transcription-repair coupling factor  58.13 
 
 		 978 aa  1105    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0078  transcription-repair coupling factor  63.62 
 
 		 981 aa  1282    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1566  transcription-repair coupling factor  51.01 
 
 		 990 aa  976    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1039  transcription-repair coupling factor  59.65 
 
 		 979 aa  1138    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.113966  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  63.45 
 
 		 981 aa  1268    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0737  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 985 aa  1984    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00351961  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0638  transcription-repair coupling factor  57.93 
 
 		 978 aa  1100    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  41.17 
 
 		 1155 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  40.6 
 
 		 1157 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1157 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1160 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  41.19 
 
 		 1147 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  41.71 
 
 		 1143 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1178 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  40.16 
 
 		 1157 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  40.9 
 
 		 1157 aa  499  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  42.79 
 
 		 1164 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  41.14 
 
 		 1153 aa  499  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  40.45 
 
 		 1151 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1162 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  41.11 
 
 		 1153 aa  496  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1153 aa  495  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1153 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  39.41 
 
 		 1153 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1155 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  39.42 
 
 		 1157 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  40.13 
 
 		 1207 aa  492  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  39.2 
 
 		 1158 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  39.33 
 
 		 1158 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  38.82 
 
 		 1159 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  39.91 
 
 		 1271 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  41.06 
 
 		 1162 aa  492  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  40.36 
 
 		 1160 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  40.36 
 
 		 1160 aa  493  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  40.36 
 
 		 1160 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  39.42 
 
 		 1157 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  40.13 
 
 		 1164 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  40.03 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1183 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  40.16 
 
 		 1179 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  38.84 
 
 		 1103 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  42.76 
 
 		 1167 aa  489  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1148 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1174 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  39.64 
 
 		 1159 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  37.5 
 
 		 1157 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  40.35 
 
 		 1150 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  40.1 
 
 		 1141 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  40.2 
 
 		 1162 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  40.75 
 
 		 1145 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3640  transcription-repair coupling factor  40.18 
 
 		 1170 aa  485  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  40.15 
 
 		 1200 aa  485  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  38.31 
 
 		 1177 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0579  transcription-repair coupling factor  42.47 
 
 		 1122 aa  482  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4163  transcription-repair coupling factor  39.47 
 
 		 1196 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7185  transcription-repair coupling factor  41.25 
 
 		 1190 aa  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1148 aa  482  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  38.43 
 
 		 1165 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  40.1 
 
 		 1149 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1148 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1150 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  37.35 
 
 		 1157 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1165 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  36.6 
 
 		 1150 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1653  transcription-repair coupling factor  39.7 
 
 		 1194 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4532  transcription-repair coupling factor  39.77 
 
 		 1196 aa  482  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.850755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  38.57 
 
 		 1160 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  40.92 
 
 		 1149 aa  482  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  38.68 
 
 		 1173 aa  483  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6308  transcription-repair coupling factor  41.06 
 
 		 1203 aa  479  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1150 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1484  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 		 1243 aa  476  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.704172  normal  0.0864414 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0798  transcription-repair coupling factor  41.54 
 
 		 1163 aa  479  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2220  transcription-repair coupling factor  38.36 
 
 		 1157 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  40.31 
 
 		 1150 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  37.8 
 
 		 1150 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1178 aa  479  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  39.17 
 
 		 1166 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  38.34 
 
 		 1164 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4262  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1168 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  39.24 
 
 		 1176 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  38.06 
 
 		 1189 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1399  transcription-repair coupling factor  41.82 
 
 		 1171 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779162  normal  0.977146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  38.36 
 
 		 1157 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  38.71 
 
 		 1156 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0544  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1132 aa  476  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  39.57 
 
 		 1137 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1148 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1148 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  37.64 
 
 		 1150 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  39.38 
 
 		 1156 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1148 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  38.87 
 
 		 1170 aa  476  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  39.5 
 
 		 1149 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1148 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  35.18 
 
 		 1207 aa  475  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>