More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0078 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0078  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 981 aa  1979    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1228  transcription-repair coupling factor  60.29 
 
 		 978 aa  1133    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1039  transcription-repair coupling factor  60.29 
 
 		 979 aa  1157    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.113966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0469  transcription-repair coupling factor  61.95 
 
 		 986 aa  1208    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1103  transcription-repair coupling factor  60.49 
 
 		 978 aa  1137    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1613  transcription-repair coupling factor  52.13 
 
 		 989 aa  983    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1566  transcription-repair coupling factor  49.09 
 
 		 990 aa  944    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0638  transcription-repair coupling factor  60.69 
 
 		 978 aa  1138    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0714  transcription-repair coupling factor  79.71 
 
 		 981 aa  1614    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.721642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0737  transcription-repair coupling factor  63.62 
 
 		 985 aa  1268    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00351961  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  33.48 
 
 		 1103 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  40.41 
 
 		 1157 aa  515  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1207 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  41.87 
 
 		 1145 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  39.39 
 
 		 1150 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  41.29 
 
 		 1157 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1178 aa  505  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  40.03 
 
 		 1157 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1150 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  42 
 
 		 1153 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  41.9 
 
 		 1149 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  39.87 
 
 		 1157 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  40.33 
 
 		 1147 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  39.06 
 
 		 1149 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  38.18 
 
 		 1159 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1160 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  40.28 
 
 		 1155 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1151 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  41.15 
 
 		 1143 aa  497  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  41.29 
 
 		 1148 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  40.06 
 
 		 1155 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0579  transcription-repair coupling factor  41.6 
 
 		 1122 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  40.81 
 
 		 1148 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  39.84 
 
 		 1160 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1137 aa  496  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  38.97 
 
 		 1149 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  39.84 
 
 		 1160 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  41.03 
 
 		 1173 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1149 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  40.3 
 
 		 1164 aa  492  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1149 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1157 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0894  transcription-repair coupling factor  38.84 
 
 		 1173 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180496  normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  33.37 
 
 		 1126 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1179 aa  492  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1174 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1148 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  38.61 
 
 		 1157 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1141 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  39.62 
 
 		 1160 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1164 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0544  transcription-repair coupling factor  41.44 
 
 		 1132 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  39.12 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  38.43 
 
 		 1153 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  42.52 
 
 		 1153 aa  489  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1170 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  40.98 
 
 		 1159 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1164 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1156 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  40.35 
 
 		 1271 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  39.27 
 
 		 1148 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  40.13 
 
 		 1162 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  39.35 
 
 		 1160 aa  489  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  42.35 
 
 		 1153 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3640  transcription-repair coupling factor  40.64 
 
 		 1170 aa  489  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1148 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0539  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1116 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0291296  hitchhiker  0.00000000346725 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1148 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1148 aa  486  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1153 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  38.07 
 
 		 1112 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1148 aa  486  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1148 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0369  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1149 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  42.03 
 
 		 1158 aa  486  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  39.12 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1183 aa  484  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1148 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1148 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  39.44 
 
 		 1162 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  38.8 
 
 		 1150 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  33.26 
 
 		 1115 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  38.01 
 
 		 1150 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  41.08 
 
 		 1198 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  37.85 
 
 		 1150 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1148 aa  486  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  40.64 
 
 		 1147 aa  482  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1500  transcription-repair coupling factor  38.51 
 
 		 1163 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0625318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  39.35 
 
 		 1165 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2850  transcription-repair coupling factor (helicase)  38.51 
 
 		 1165 aa  482  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.74664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1443  transcription-repair coupling factor  37.56 
 
 		 1165 aa  482  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0802912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  38.37 
 
 		 1164 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  38.63 
 
 		 1176 aa  482  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2622  transcription-repair coupling factor  38.86 
 
 		 1172 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153021  hitchhiker  0.000463296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  38.06 
 
 		 1162 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  38.48 
 
 		 1171 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>