More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0765 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4262  transcription-repair coupling factor  34.75 
 
 		 1168 aa  728    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1754  transcription-repair coupling factor  34.25 
 
 		 1144 aa  783    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.430393  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0579  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1122 aa  743    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1399  transcription-repair coupling factor  36.23 
 
 		 1171 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779162  normal  0.977146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4157  transcription repair coupling factor  37.2 
 
 		 1171 aa  770    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  35.53 
 
 		 1171 aa  762    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4163  transcription-repair coupling factor  33.97 
 
 		 1196 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0765  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1128 aa  2278    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.267338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  38.6 
 
 		 1174 aa  790    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2850  transcription-repair coupling factor (helicase)  35.05 
 
 		 1165 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.74664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  34.85 
 
 		 1156 aa  771    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1500  transcription-repair coupling factor  35.15 
 
 		 1163 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0625318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1730  transcription-repair coupling factor  35.39 
 
 		 1167 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0544  transcription-repair coupling factor  37.35 
 
 		 1132 aa  742    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  34.2 
 
 		 1195 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  34.06 
 
 		 1200 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1726  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1177 aa  777    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3640  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1170 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2366  transcription-repair coupling factor  34.74 
 
 		 1175 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2850  transcription-repair coupling factor  36.46 
 
 		 1171 aa  786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  34.85 
 
 		 1164 aa  715    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0250  transcription-repair coupling factor  82.49 
 
 		 1134 aa  1820    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2322  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1153 aa  716    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.831848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2610  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1172 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1647  transcription-repair coupling factor  35.05 
 
 		 1198 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0790633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1914  transcription-repair coupling factor  35.48 
 
 		 1166 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2622  transcription-repair coupling factor  36.69 
 
 		 1172 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153021  hitchhiker  0.000463296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2053  transcription-repair coupling factor  37.25 
 
 		 1173 aa  786    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0242332  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2211  transcription-repair coupling factor  35.2 
 
 		 1176 aa  686    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1349  transcription-repair coupling factor  34.22 
 
 		 1149 aa  753    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1653  transcription-repair coupling factor  34.63 
 
 		 1194 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2619  transcription-repair coupling factor  35.42 
 
 		 1155 aa  736    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4532  transcription-repair coupling factor  34.06 
 
 		 1196 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.850755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7185  transcription-repair coupling factor  33.87 
 
 		 1190 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  35.75 
 
 		 1167 aa  771    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1561  transcription repair coupling factor  35.01 
 
 		 1160 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224407  normal  0.305942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2938  transcription-repair coupling factor  36.7 
 
 		 1172 aa  786    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1485  transcription-repair coupling factor  35.29 
 
 		 1172 aa  773    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1443  transcription-repair coupling factor  35.14 
 
 		 1165 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0802912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0894  transcription-repair coupling factor  34.52 
 
 		 1173 aa  730    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180496  normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6308  transcription-repair coupling factor  34.38 
 
 		 1203 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0798  transcription-repair coupling factor  39.41 
 
 		 1163 aa  763    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3811  transcription-repair coupling factor  34.99 
 
 		 1154 aa  735    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  31.56 
 
 		 1166 aa  621  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  32.75 
 
 		 1155 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  32.14 
 
 		 1149 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  33.56 
 
 		 1157 aa  613  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  33.01 
 
 		 1150 aa  615  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1617  transcription-repair coupling factor  33.46 
 
 		 1147 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.89425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  32.63 
 
 		 1148 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  31.94 
 
 		 1148 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  31.94 
 
 		 1164 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  30.5 
 
 		 1147 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  32.95 
 
 		 1150 aa  611  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  32.95 
 
 		 1150 aa  610  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  32.26 
 
 		 1165 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  32.03 
 
 		 1148 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  32.19 
 
 		 1176 aa  612  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1148 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  31.94 
 
 		 1148 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  31.58 
 
 		 1157 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  32.03 
 
 		 1148 aa  611  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  32.63 
 
 		 1148 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  31.94 
 
 		 1164 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  33.37 
 
 		 1157 aa  611  1e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  32.03 
 
 		 1148 aa  611  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  32.03 
 
 		 1148 aa  609  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  32.3 
 
 		 1156 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  31.51 
 
 		 1198 aa  606  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  31.53 
 
 		 1148 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  32.34 
 
 		 1149 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  31.69 
 
 		 1148 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  32.05 
 
 		 1149 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  31.53 
 
 		 1148 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  31.53 
 
 		 1148 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  32.06 
 
 		 1149 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  33.24 
 
 		 1158 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  31.53 
 
 		 1148 aa  602  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  32.43 
 
 		 1157 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  31.84 
 
 		 1160 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  31.84 
 
 		 1150 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  32.05 
 
 		 1149 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  32.12 
 
 		 1150 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1593  transcription-repair coupling factor  32.15 
 
 		 1145 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.383279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1965  transcription-repair coupling factor  31.87 
 
 		 1147 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550833  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  31.43 
 
 		 1148 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  31.42 
 
 		 1158 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  33.08 
 
 		 1153 aa  599  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  31.64 
 
 		 1148 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  31.86 
 
 		 1141 aa  599  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  32.08 
 
 		 1154 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  32.5 
 
 		 1148 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  31.14 
 
 		 1207 aa  594  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1656  transcription-repair coupling factor  32.19 
 
 		 1146 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  31.21 
 
 		 1164 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1575  transcription-repair coupling factor  31.46 
 
 		 1143 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221185  normal  0.0233451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003994  transcription-repair coupling factor  31.93 
 
 		 1153 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  31.53 
 
 		 1159 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  32.4 
 
 		 1148 aa  595  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  34.17 
 
 		 1163 aa  591  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>