153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2259 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  100 
 
 		 716 aa  1489    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  32.21 
 
 		 499 aa  261  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  33.2 
 
 		 453 aa  254  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  31.84 
 
 		 449 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  32.61 
 
 		 449 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  32.42 
 
 		 450 aa  239  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  32.61 
 
 		 449 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  31.97 
 
 		 451 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  32.61 
 
 		 449 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  32.68 
 
 		 449 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  30.92 
 
 		 463 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  32.22 
 
 		 451 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  32.22 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  35.53 
 
 		 374 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  30.35 
 
 		 623 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  35 
 
 		 374 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  30.47 
 
 		 425 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  30.61 
 
 		 426 aa  174  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  28.46 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  27.91 
 
 		 443 aa  172  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  28.09 
 
 		 429 aa  163  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  28.91 
 
 		 387 aa  158  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  20.83 
 
 		 754 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  24.5 
 
 		 727 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.87 
 
 		 675 aa  56.6  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  21.56 
 
 		 914 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  22.76 
 
 		 1169 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.18 
 
 		 672 aa  53.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  23.7 
 
 		 1168 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  23.7 
 
 		 1168 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  21.64 
 
 		 720 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  21.64 
 
 		 720 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.46 
 
 		 773 aa  50.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3341  primosome assembly protein PriA  22.44 
 
 		 761 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000327838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.59 
 
 		 692 aa  50.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.94 
 
 		 812 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  41.56 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  28.03 
 
 		 832 aa  50.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2030  excinuclease ABC subunit B  40 
 
 		 690 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0667365  normal  0.695875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.94 
 
 		 723 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  23.91 
 
 		 804 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0921  excinuclease ABC, B subunit  40.79 
 
 		 658 aa  49.3  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  29.46 
 
 		 1183 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1397  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.7 
 
 		 696 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0946  excinuclease ABC, B subunit  36.9 
 
 		 746 aa  49.3  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.28 
 
 		 695 aa  48.9  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  21.34 
 
 		 1170 aa  48.5  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  22.04 
 
 		 624 aa  48.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1506  excinuclease ABC subunit B  40 
 
 		 658 aa  48.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  35.37 
 
 		 1168 aa  48.1  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.57 
 
 		 701 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  22.07 
 
 		 1246 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  21.2 
 
 		 1167 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.4 
 
 		 701 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43765  predicted protein  36.14 
 
 		 690 aa  47.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0853218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  22.52 
 
 		 1166 aa  47.4  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  32.56 
 
 		 1169 aa  47.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  32.93 
 
 		 1165 aa  47  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  40.38 
 
 		 1170 aa  47  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.05 
 
 		 460 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.04 
 
 		 702 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0542  excinuclease ABC, B subunit  40 
 
 		 684 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  30.86 
 
 		 1179 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1430  primosomal protein N'  28.15 
 
 		 764 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0145325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.39 
 
 		 1134 aa  47  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6310  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.74 
 
 		 704 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1827  excinuclease ABC subunit B  34.67 
 
 		 683 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.54987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  29.29 
 
 		 1197 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  25.17 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  23.51 
 
 		 1179 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.28 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  24.3 
 
 		 1168 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  21.57 
 
 		 1158 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  21.94 
 
 		 1169 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  41.38 
 
 		 1158 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  29.63 
 
 		 1165 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0875  excinuclease ABC subunit B  35.96 
 
 		 676 aa  45.4  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1515  DEAD/DEAH box helicase  29.9 
 
 		 699 aa  45.8  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.031293 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  37.66 
 
 		 678 aa  45.8  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1113 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  22.6 
 
 		 848 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2620  DEAD/DEAH box helicase-like  30.21 
 
 		 727 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183733  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  30.88 
 
 		 1175 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0782  excinuclease ABC subunit B  38.96 
 
 		 661 aa  45.8  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.24339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.03 
 
 		 686 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  21.8 
 
 		 1265 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0799  excinuclease ABC subunit B  38.96 
 
 		 661 aa  45.8  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 		 974 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 		 763 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2516  excinuclease ABC, B subunit  35.11 
 
 		 716 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.22 
 
 		 671 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.66 
 
 		 850 aa  45.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  37.66 
 
 		 662 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  22.88 
 
 		 825 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  20.98 
 
 		 725 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.39 
 
 		 779 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.33 
 
 		 722 aa  45.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>