More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4727 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
460 aa  902    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  47.65 
 
 
649 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  40.35 
 
 
460 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  44.81 
 
 
697 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.48 
 
 
471 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.07 
 
 
621 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.07 
 
 
548 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.48 
 
 
580 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.28 
 
 
565 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.9 
 
 
541 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.56 
 
 
480 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.03 
 
 
559 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44 
 
 
571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.93 
 
 
567 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  43.8 
 
 
528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.97 
 
 
557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.48 
 
 
611 aa  284  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  44.15 
 
 
572 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.35 
 
 
498 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.89 
 
 
565 aa  283  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.09 
 
 
544 aa  283  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.09 
 
 
533 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
618 aa  282  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.68 
 
 
598 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.19 
 
 
532 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.87 
 
 
447 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  40.86 
 
 
482 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.81 
 
 
643 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0145  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.71 
 
 
446 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.68 
 
 
494 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  36.9 
 
 
450 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.61 
 
 
580 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.49 
 
 
450 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  42.21 
 
 
527 aa  280  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.86 
 
 
474 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  36.9 
 
 
450 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  43.21 
 
 
484 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.9 
 
 
450 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.9 
 
 
450 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  41.22 
 
 
469 aa  280  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.9 
 
 
450 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  39.24 
 
 
491 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.2 
 
 
513 aa  279  7e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.13 
 
 
671 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  42.32 
 
 
656 aa  279  8e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.11 
 
 
536 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.59 
 
 
449 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.55 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  44.67 
 
 
551 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.27 
 
 
585 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.55 
 
 
507 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.55 
 
 
507 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38 
 
 
511 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.29 
 
 
503 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.02 
 
 
445 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.44 
 
 
532 aa  276  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  39.33 
 
 
476 aa  277  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.04 
 
 
441 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  37.87 
 
 
450 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.05 
 
 
609 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0163  ATP-dependent RNA helicase  41.46 
 
 
446 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.35 
 
 
591 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  36.65 
 
 
510 aa  276  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.32 
 
 
595 aa  276  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  37.62 
 
 
458 aa  276  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.09 
 
 
541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.54 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.64 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.98 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  38.31 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.8 
 
 
546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.39 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.72 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.79 
 
 
498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.64 
 
 
510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.68 
 
 
511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  39.8 
 
 
421 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.35 
 
 
573 aa  274  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  39.89 
 
 
454 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.71 
 
 
593 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.06 
 
 
505 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.09 
 
 
546 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.55 
 
 
582 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
635 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.89 
 
 
605 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.4 
 
 
538 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.86 
 
 
447 aa  272  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.97 
 
 
506 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 
533 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.28 
 
 
528 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.58 
 
 
460 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  39.84 
 
 
419 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  39.42 
 
 
492 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  44.8 
 
 
460 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.95 
 
 
561 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.44 
 
 
530 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.03 
 
 
609 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  45.03 
 
 
609 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
589 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>