More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2906 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.39 
 
 
565 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.62 
 
 
605 aa  682    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.35 
 
 
544 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  70.47 
 
 
593 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  73.9 
 
 
611 aa  638    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.58 
 
 
561 aa  664    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.41 
 
 
585 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.78 
 
 
598 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
580 aa  1134    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  73.58 
 
 
499 aa  624  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.04 
 
 
582 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.08 
 
 
611 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.17 
 
 
586 aa  558  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  66.27 
 
 
649 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.24 
 
 
609 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.43 
 
 
671 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  63.36 
 
 
503 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.27 
 
 
559 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  60.61 
 
 
697 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.74 
 
 
618 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.09 
 
 
507 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  61.85 
 
 
507 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.85 
 
 
507 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.19 
 
 
621 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.28 
 
 
548 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.38 
 
 
565 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7820  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.65 
 
 
795 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.21 
 
 
536 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60 
 
 
516 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.44 
 
 
543 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.05 
 
 
494 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.43 
 
 
557 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.81 
 
 
505 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  52.56 
 
 
527 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.71 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.77 
 
 
533 aa  340  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.48 
 
 
541 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.47 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.65 
 
 
466 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.1 
 
 
550 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.04 
 
 
550 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.29 
 
 
511 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.49 
 
 
606 aa  317  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.71 
 
 
530 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.79 
 
 
538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.97 
 
 
530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.75 
 
 
539 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.79 
 
 
525 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.17 
 
 
528 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
528 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.79 
 
 
525 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.79 
 
 
528 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
528 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.79 
 
 
528 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.79 
 
 
528 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
533 aa  312  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.65 
 
 
546 aa  312  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  42.12 
 
 
579 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.49 
 
 
532 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  41.49 
 
 
527 aa  312  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
529 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.38 
 
 
546 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  42.66 
 
 
530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  41.24 
 
 
551 aa  310  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.21 
 
 
571 aa  310  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
640 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.87 
 
 
640 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
640 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.19 
 
 
541 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
640 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
640 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.65 
 
 
597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.4 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.06 
 
 
747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  42.5 
 
 
589 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.88 
 
 
611 aa  306  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.37 
 
 
595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.27 
 
 
694 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.27 
 
 
664 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.57 
 
 
655 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.12 
 
 
653 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.47 
 
 
447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.27 
 
 
664 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.27 
 
 
664 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.02 
 
 
506 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.02 
 
 
506 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.24 
 
 
589 aa  303  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.8 
 
 
623 aa  302  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.02 
 
 
509 aa  302  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  42.47 
 
 
450 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.48 
 
 
527 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.38 
 
 
450 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  36.9 
 
 
450 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.18 
 
 
415 aa  302  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.25 
 
 
528 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.25 
 
 
528 aa  302  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  36.9 
 
 
450 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.52 
 
 
624 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>