More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7820 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7820  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
795 aa  1556    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.82 
 
 
565 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.28 
 
 
586 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.08 
 
 
593 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  55.91 
 
 
697 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.28 
 
 
605 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.12 
 
 
544 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.43 
 
 
671 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.44 
 
 
585 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.98 
 
 
611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.14 
 
 
561 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  71.84 
 
 
649 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.28 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.32 
 
 
580 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  63.48 
 
 
503 aa  505  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.86 
 
 
598 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.49 
 
 
582 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.1 
 
 
559 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.44 
 
 
516 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.8 
 
 
609 aa  489  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  66.86 
 
 
499 aa  475  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.03 
 
 
565 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  65.42 
 
 
611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.89 
 
 
543 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.21 
 
 
548 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.89 
 
 
621 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.65 
 
 
536 aa  462  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.39 
 
 
494 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  64.01 
 
 
527 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.5 
 
 
505 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.64 
 
 
507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  63.94 
 
 
507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.85 
 
 
479 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.94 
 
 
507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.3 
 
 
557 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  45.22 
 
 
530 aa  290  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.91 
 
 
532 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.64 
 
 
533 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  47.72 
 
 
527 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.92 
 
 
528 aa  283  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.92 
 
 
528 aa  283  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.26 
 
 
467 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  38.89 
 
 
527 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38.64 
 
 
559 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 
509 aa  280  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 
511 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.36 
 
 
571 aa  280  9e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.02 
 
 
528 aa  279  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  38.26 
 
 
629 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  38.64 
 
 
482 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.64 
 
 
482 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  38.64 
 
 
482 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  38.64 
 
 
482 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  38.64 
 
 
481 aa  280  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.64 
 
 
482 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.61 
 
 
463 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.44 
 
 
466 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 
497 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.26 
 
 
629 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.92 
 
 
441 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  39.29 
 
 
520 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 
520 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 
520 aa  279  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.81 
 
 
489 aa  278  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.93 
 
 
530 aa  278  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 
630 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.61 
 
 
482 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 
627 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.5 
 
 
626 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.58 
 
 
415 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  47.74 
 
 
551 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.64 
 
 
584 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 
626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38.33 
 
 
491 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.52 
 
 
632 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  39.02 
 
 
516 aa  273  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.54 
 
 
541 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.06 
 
 
525 aa  272  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  48.36 
 
 
528 aa  272  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.81 
 
 
562 aa  272  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  37.77 
 
 
622 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.78 
 
 
460 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.47 
 
 
540 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  47.06 
 
 
525 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.53 
 
 
570 aa  272  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.36 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  48.36 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.36 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.63 
 
 
448 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  48.36 
 
 
533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  48.36 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.37 
 
 
539 aa  271  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.18 
 
 
451 aa  271  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  48.36 
 
 
529 aa  271  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.71 
 
 
538 aa  271  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.37 
 
 
511 aa  271  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  41.03 
 
 
492 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  39.39 
 
 
608 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.16 
 
 
627 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.47 
 
 
438 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>