More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3515 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
543 aa  1082    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.75 
 
 
536 aa  663    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.82 
 
 
505 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.75 
 
 
494 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  66.39 
 
 
527 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  70.21 
 
 
507 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.98 
 
 
507 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.21 
 
 
507 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.47 
 
 
559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.88 
 
 
609 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.84 
 
 
586 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.74 
 
 
611 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.17 
 
 
565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.82 
 
 
544 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  59.63 
 
 
649 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.24 
 
 
611 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.17 
 
 
593 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.52 
 
 
598 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.62 
 
 
671 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.51 
 
 
585 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.51 
 
 
561 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.13 
 
 
499 aa  492  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.44 
 
 
580 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.9 
 
 
605 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.05 
 
 
618 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  59.31 
 
 
697 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.8 
 
 
503 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.69 
 
 
548 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.22 
 
 
621 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.97 
 
 
565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.42 
 
 
557 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.93 
 
 
582 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.53 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.59 
 
 
479 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7820  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.58 
 
 
795 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44 
 
 
528 aa  309  8e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.8 
 
 
528 aa  302  9e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.8 
 
 
528 aa  302  9e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  41.1 
 
 
527 aa  301  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.11 
 
 
533 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.8 
 
 
530 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.88 
 
 
514 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  40.84 
 
 
530 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  43.17 
 
 
731 aa  296  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.31 
 
 
550 aa  296  8e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.29 
 
 
448 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.55 
 
 
546 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.04 
 
 
445 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.67 
 
 
595 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.89 
 
 
541 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  42.78 
 
 
563 aa  294  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
546 aa  293  6e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.6 
 
 
467 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  40.97 
 
 
424 aa  292  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.16 
 
 
541 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.58 
 
 
664 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  41.41 
 
 
551 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.44 
 
 
747 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.93 
 
 
532 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.34 
 
 
532 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.87 
 
 
466 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.93 
 
 
694 aa  290  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.33 
 
 
664 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.33 
 
 
664 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.78 
 
 
624 aa  289  8e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.22 
 
 
602 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.79 
 
 
405 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.43 
 
 
653 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.78 
 
 
539 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.49 
 
 
629 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.49 
 
 
629 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.49 
 
 
629 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.49 
 
 
629 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  37.18 
 
 
639 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.84 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
655 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.86 
 
 
545 aa  287  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.49 
 
 
629 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.07 
 
 
515 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.07 
 
 
515 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.92 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  42.28 
 
 
589 aa  286  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  35.89 
 
 
635 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  42.23 
 
 
629 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.23 
 
 
629 aa  286  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  42.23 
 
 
629 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
629 aa  286  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
629 aa  286  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
629 aa  286  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
590 aa  286  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
651 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
627 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
651 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
630 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.31 
 
 
571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
651 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.9 
 
 
425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  41.49 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  41.62 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.48 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>