More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0583 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.73 
 
 		 610 aa  977    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 640 aa  1300    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  90.31 
 
 		 623 aa  1135    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  99.53 
 
 		 640 aa  1294    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.33 
 
 		 605 aa  967    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  99.38 
 
 		 640 aa  1294    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.32 
 
 		 599 aa  988    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.35 
 
 		 623 aa  957    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  84.64 
 
 		 611 aa  1039    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  78.52 
 
 		 637 aa  985    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  88.91 
 
 		 622 aa  1122    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  88.91 
 
 		 622 aa  1122    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.44 
 
 		 634 aa  1053    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 640 aa  1300    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 640 aa  1300    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  88.12 
 
 		 619 aa  1118    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.23 
 
 		 594 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  54.13 
 
 		 589 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.39 
 
 		 606 aa  609  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.96 
 
 		 632 aa  609  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  52.61 
 
 		 595 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.43 
 
 		 602 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  55.58 
 
 		 590 aa  595  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.61 
 
 		 591 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  51.9 
 
 		 574 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.64 
 
 		 589 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.26 
 
 		 599 aa  582  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.82 
 
 		 610 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  52.05 
 
 		 581 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  52.32 
 
 		 640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.61 
 
 		 617 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324399  unclonable  0.0000000000803743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  53.24 
 
 		 579 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  55.61 
 
 		 617 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.65 
 
 		 646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.13 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  52.17 
 
 		 614 aa  568  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.44 
 
 		 664 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  53.38 
 
 		 583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.44 
 
 		 664 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.79 
 
 		 677 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.41 
 
 		 609 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.44 
 
 		 664 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  50.25 
 
 		 609 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.74 
 
 		 621 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  48.97 
 
 		 653 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50 
 
 		 624 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.61 
 
 		 625 aa  543  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  48.09 
 
 		 632 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.21 
 
 		 629 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.21 
 
 		 629 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.21 
 
 		 629 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.04 
 
 		 629 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  51.04 
 
 		 629 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1726  RNA helicase DeaD  48.65 
 
 		 611 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  50.35 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.35 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.35 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.35 
 
 		 651 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.35 
 
 		 651 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.35 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.35 
 
 		 651 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  50.35 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  50.35 
 
 		 629 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1574  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.79 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.45 
 
 		 589 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  45.91 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  47.1 
 
 		 636 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10851  putative ATP-dependent RNA helicase  46.47 
 
 		 604 aa  502  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.638116  normal  0.290308 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.16 
 
 		 608 aa  502  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.91 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  47.82 
 
 		 641 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.56 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  43.61 
 
 		 589 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.31 
 
 		 589 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.78 
 
 		 694 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1046  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.99 
 
 		 627 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.835563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  45.31 
 
 		 589 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1139  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.81 
 
 		 568 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  45.63 
 
 		 601 aa  487  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  43.27 
 
 		 589 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2611  DEAD/DEAH box helicase-like  54.23 
 
 		 500 aa  485  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000048378  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  47.89 
 
 		 624 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.19 
 
 		 731 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.91 
 
 		 560 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.96 
 
 		 584 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1868  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.75 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0935982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.42 
 
 		 602 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3847  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.75 
 
 		 559 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.460611  normal  0.310213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.21 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  54.75 
 
 		 655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.21 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.21 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.31 
 
 		 559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  47.13 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.55 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  46.77 
 
 		 644 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11921  putative ATP-dependent RNA helicase  42.98 
 
 		 595 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.412089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.53 
 
 		 581 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.74 
 
 		 559 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3987  DEAD/DEAH box helicase-like  45.66 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>