More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0396 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  62.07 
 
 
528 aa  637    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 
551 aa  1104    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  69.21 
 
 
527 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.78 
 
 
498 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  54.38 
 
 
485 aa  530  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.74 
 
 
466 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  56.28 
 
 
521 aa  516  1.0000000000000001e-145  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  59.33 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.52 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.69 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.51 
 
 
525 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.51 
 
 
528 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  53.51 
 
 
528 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  53.51 
 
 
528 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  53.51 
 
 
529 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.51 
 
 
528 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  53.51 
 
 
528 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  53.51 
 
 
525 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  53.51 
 
 
533 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.99 
 
 
538 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.75 
 
 
509 aa  481  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.35 
 
 
482 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.95 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.55 
 
 
474 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.67 
 
 
565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.7 
 
 
539 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.49 
 
 
550 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.34 
 
 
584 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.95 
 
 
528 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.95 
 
 
528 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.6 
 
 
532 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.04 
 
 
590 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.26 
 
 
637 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.65 
 
 
530 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.5 
 
 
541 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.51 
 
 
611 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  48.45 
 
 
656 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.36 
 
 
640 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.64 
 
 
643 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.69 
 
 
623 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.62 
 
 
536 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.57 
 
 
550 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.19 
 
 
527 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.19 
 
 
533 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.96 
 
 
640 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  46.03 
 
 
663 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.96 
 
 
640 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.1 
 
 
599 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.94 
 
 
622 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.34 
 
 
634 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.96 
 
 
640 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.12 
 
 
610 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.75 
 
 
623 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.27 
 
 
605 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.75 
 
 
640 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  49.24 
 
 
589 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.48 
 
 
622 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.94 
 
 
619 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.35 
 
 
546 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  48.93 
 
 
595 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.66 
 
 
546 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.94 
 
 
527 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.28 
 
 
527 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.93 
 
 
532 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.79 
 
 
606 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  43.7 
 
 
574 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  44.4 
 
 
644 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000079582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  43.59 
 
 
530 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.92 
 
 
646 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  43.76 
 
 
572 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  41.62 
 
 
641 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.28 
 
 
541 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  49.33 
 
 
580 aa  369  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
589 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.62 
 
 
583 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.88 
 
 
531 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.65 
 
 
607 aa  363  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.92 
 
 
599 aa  362  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.67 
 
 
632 aa  362  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  49.19 
 
 
590 aa  362  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  42.35 
 
 
640 aa  362  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  46.19 
 
 
579 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.61 
 
 
481 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.85 
 
 
530 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.73 
 
 
610 aa  360  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  47.98 
 
 
531 aa  360  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1767  DEAD/DEAH box helicase-like  40.82 
 
 
540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  45.39 
 
 
581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.86 
 
 
447 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  49.86 
 
 
450 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.57 
 
 
591 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.3 
 
 
450 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.86 
 
 
450 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.1 
 
 
602 aa  356  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.25 
 
 
608 aa  356  7.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  49.58 
 
 
450 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.58 
 
 
450 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.02 
 
 
594 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>