More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1118 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.93 
 
 
543 aa  668    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
536 aa  1066    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.95 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.6 
 
 
494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.31 
 
 
609 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  69.46 
 
 
507 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.46 
 
 
507 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  69.95 
 
 
527 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  69.46 
 
 
507 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.56 
 
 
559 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.68 
 
 
586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.02 
 
 
611 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.09 
 
 
611 aa  521  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.27 
 
 
544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.97 
 
 
561 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.58 
 
 
598 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.59 
 
 
605 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  60.9 
 
 
649 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.07 
 
 
565 aa  501  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.11 
 
 
593 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.39 
 
 
585 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.82 
 
 
671 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.21 
 
 
580 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.95 
 
 
548 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.92 
 
 
499 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  58.69 
 
 
697 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.51 
 
 
618 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.06 
 
 
582 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.04 
 
 
621 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  57.77 
 
 
503 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.22 
 
 
479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.55 
 
 
565 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.26 
 
 
557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7820  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.09 
 
 
795 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.7 
 
 
533 aa  324  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  41.62 
 
 
530 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.54 
 
 
467 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.09 
 
 
528 aa  311  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  42.29 
 
 
527 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.37 
 
 
550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.24 
 
 
530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 
541 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.54 
 
 
528 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.54 
 
 
528 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.86 
 
 
466 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  41.95 
 
 
579 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
546 aa  300  6e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.53 
 
 
546 aa  299  7e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4475  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.16 
 
 
457 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.8 
 
 
482 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.6 
 
 
445 aa  296  7e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.48 
 
 
511 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  41.25 
 
 
551 aa  296  7e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.37 
 
 
530 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.91 
 
 
571 aa  295  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
541 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.82 
 
 
539 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.22 
 
 
538 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.27 
 
 
590 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  43.17 
 
 
529 aa  293  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.17 
 
 
525 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  43.17 
 
 
528 aa  293  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.17 
 
 
525 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.17 
 
 
528 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  43.17 
 
 
528 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.17 
 
 
528 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.17 
 
 
528 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.37 
 
 
530 aa  292  8e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.53 
 
 
580 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.78 
 
 
595 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.94 
 
 
529 aa  291  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  43.17 
 
 
533 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.47 
 
 
532 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.47 
 
 
640 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.62 
 
 
655 aa  291  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.47 
 
 
640 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.47 
 
 
640 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.19 
 
 
439 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.47 
 
 
640 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.41 
 
 
532 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.21 
 
 
527 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0642  DEAD/DEAH box helicase-like  41.42 
 
 
513 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.770015  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.79 
 
 
567 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 
538 aa  289  9e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  39.11 
 
 
424 aa  289  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.73 
 
 
562 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  41.07 
 
 
589 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
630 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  43.51 
 
 
579 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 
584 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.21 
 
 
640 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.78 
 
 
626 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
627 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.78 
 
 
441 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  40.11 
 
 
656 aa  288  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  42.26 
 
 
622 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  41.15 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.6 
 
 
626 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.03 
 
 
664 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>