More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0948 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
530 aa  1069    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  51.7 
 
 
579 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.81 
 
 
529 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.33 
 
 
541 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.44 
 
 
546 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.62 
 
 
546 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.19 
 
 
514 aa  527  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.16 
 
 
538 aa  521  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.4 
 
 
530 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.26 
 
 
571 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.36 
 
 
530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.4 
 
 
543 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.19 
 
 
570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.59 
 
 
539 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 
532 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.33 
 
 
541 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.92 
 
 
530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.62 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  40.11 
 
 
572 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.43 
 
 
531 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 
527 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  39.92 
 
 
530 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  39.49 
 
 
656 aa  389  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.05 
 
 
527 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.65 
 
 
467 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.51 
 
 
527 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.59 
 
 
561 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.36 
 
 
595 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.1 
 
 
565 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.97 
 
 
562 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  39.63 
 
 
574 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.85 
 
 
550 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.92 
 
 
533 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.84 
 
 
532 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.73 
 
 
466 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
550 aa  379  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.86 
 
 
562 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.72 
 
 
532 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.16 
 
 
570 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.87 
 
 
528 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.87 
 
 
528 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
574 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  36.92 
 
 
561 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.52 
 
 
511 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.04 
 
 
602 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.13 
 
 
581 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.08 
 
 
581 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  39.32 
 
 
589 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.79 
 
 
597 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  41.82 
 
 
528 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.82 
 
 
538 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.07 
 
 
590 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.14 
 
 
747 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.07 
 
 
589 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.82 
 
 
528 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.02 
 
 
482 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  41.82 
 
 
528 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  41.82 
 
 
533 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  45.06 
 
 
590 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.82 
 
 
528 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.82 
 
 
528 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 
579 aa  364  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.85 
 
 
474 aa  364  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.59 
 
 
525 aa  363  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  41.59 
 
 
525 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  41.59 
 
 
529 aa  363  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.57 
 
 
557 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.09 
 
 
559 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.57 
 
 
557 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.57 
 
 
557 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  36.48 
 
 
636 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.28 
 
 
564 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_002950  PG0086  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.77 
 
 
604 aa  358  9.999999999999999e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.389821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2611  DEAD/DEAH box helicase-like  40.94 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000048378  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.03 
 
 
498 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.06 
 
 
610 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.38 
 
 
634 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.48 
 
 
677 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.12 
 
 
632 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.86 
 
 
599 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.03 
 
 
731 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.01 
 
 
594 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.23 
 
 
589 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.85 
 
 
595 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.86 
 
 
625 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  37.55 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.21 
 
 
611 aa  352  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.26 
 
 
694 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.26 
 
 
646 aa  352  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  36.03 
 
 
579 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  45.43 
 
 
580 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.75 
 
 
606 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.35 
 
 
405 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  42.69 
 
 
485 aa  350  4e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  36.5 
 
 
607 aa  350  5e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  36.1 
 
 
624 aa  348  9e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.28 
 
 
589 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43 
 
 
591 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  43.86 
 
 
640 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.13 
 
 
637 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>