More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0439 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
441 aa  884    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  61.21 
 
 
533 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.51 
 
 
450 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.87 
 
 
453 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  51.89 
 
 
452 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.48 
 
 
634 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  55.36 
 
 
472 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.79 
 
 
627 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.33 
 
 
632 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.86 
 
 
454 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.67 
 
 
449 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.79 
 
 
627 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.91 
 
 
453 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.28 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.39 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  55.14 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.35 
 
 
430 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.14 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  55.69 
 
 
608 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  54.89 
 
 
516 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.92 
 
 
505 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.46 
 
 
512 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.66 
 
 
482 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  54.66 
 
 
513 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.84 
 
 
556 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.09 
 
 
542 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  54.34 
 
 
537 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.89 
 
 
512 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.66 
 
 
516 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  54.66 
 
 
516 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  54.66 
 
 
529 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  54.66 
 
 
516 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  54.66 
 
 
516 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  54.46 
 
 
514 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  53.16 
 
 
435 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.1 
 
 
502 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.3 
 
 
516 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  51.85 
 
 
552 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  47.07 
 
 
567 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.52 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
482 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  49.88 
 
 
516 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.15 
 
 
628 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.67 
 
 
425 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0924  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.1 
 
 
403 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  47.34 
 
 
629 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  48.27 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.34 
 
 
629 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.45 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.15 
 
 
630 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  46.63 
 
 
622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.71 
 
 
627 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.91 
 
 
504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.62 
 
 
565 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  47.76 
 
 
540 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.15 
 
 
626 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.17 
 
 
626 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.57 
 
 
522 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.16 
 
 
533 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.79 
 
 
443 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  45.23 
 
 
491 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.48 
 
 
426 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.62 
 
 
560 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.27 
 
 
471 aa  333  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.04 
 
 
540 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  45.9 
 
 
453 aa  332  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.21 
 
 
439 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  47.45 
 
 
484 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.45 
 
 
486 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  45.95 
 
 
482 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  44.82 
 
 
460 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.92 
 
 
511 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  41.19 
 
 
639 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.45 
 
 
480 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.87 
 
 
485 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.87 
 
 
485 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.87 
 
 
485 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  46.87 
 
 
485 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  46.87 
 
 
485 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  47.45 
 
 
486 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.45 
 
 
486 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.39 
 
 
418 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.97 
 
 
571 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  45.77 
 
 
469 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.21 
 
 
578 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.21 
 
 
577 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.19 
 
 
479 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.19 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  42.28 
 
 
543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  46.37 
 
 
635 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.19 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  44.29 
 
 
623 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  45.21 
 
 
574 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.92 
 
 
456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.85 
 
 
581 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.62 
 
 
559 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  44.37 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.52 
 
 
488 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  45.72 
 
 
579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  44.99 
 
 
420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>