More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1413 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2693  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.34 
 
 		 616 aa  750    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1484  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.54 
 
 		 661 aa  759    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.63 
 
 		 707 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 623 aa  1269    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1471  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.52 
 
 		 649 aa  755    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.25269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1701  DEAD/DEAH box helicase-like  62.86 
 
 		 624 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0325  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.36 
 
 		 609 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1894  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.96 
 
 		 619 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3345  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.3 
 
 		 625 aa  750    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.049503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  53.47 
 
 		 516 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.64 
 
 		 500 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.05 
 
 		 482 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.03 
 
 		 632 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.22 
 
 		 634 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.81 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.72 
 
 		 627 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.72 
 
 		 627 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.14 
 
 		 556 aa  355  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  45.92 
 
 		 608 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.52 
 
 		 505 aa  352  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.15 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.21 
 
 		 512 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  44.65 
 
 		 516 aa  346  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.5 
 
 		 514 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  41.51 
 
 		 533 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.82 
 
 		 482 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  44.26 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.26 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.73 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  42.73 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  42.73 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  42.73 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  42.73 
 
 		 514 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  42.73 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  43.12 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.15 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  42.76 
 
 		 537 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.04 
 
 		 441 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.79 
 
 		 542 aa  334  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  38.29 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.05 
 
 		 450 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  39.27 
 
 		 452 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.49 
 
 		 430 aa  318  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.83 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  39.41 
 
 		 435 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  35.78 
 
 		 567 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.3 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.71 
 
 		 453 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  36.52 
 
 		 552 aa  306  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.86 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.44 
 
 		 516 aa  296  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.14 
 
 		 418 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.14 
 
 		 418 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.52 
 
 		 545 aa  277  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.39 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.34 
 
 		 628 aa  274  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.34 
 
 		 484 aa  273  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.12 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.35 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 		 433 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 		 433 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.24 
 
 		 433 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 		 433 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.71 
 
 		 433 aa  270  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.73 
 
 		 455 aa  270  8e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  33.04 
 
 		 527 aa  270  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2800  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.34 
 
 		 408 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0135587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.51 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  37 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.11 
 
 		 497 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.31 
 
 		 629 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  39.72 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  37.92 
 
 		 622 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  36.57 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.7 
 
 		 433 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.09 
 
 		 630 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  36.8 
 
 		 559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.7 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.93 
 
 		 433 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.67 
 
 		 436 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  36.8 
 
 		 481 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.8 
 
 		 482 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  36.8 
 
 		 482 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  36.8 
 
 		 482 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.8 
 
 		 482 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.7 
 
 		 433 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  36.8 
 
 		 482 aa  267  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  32.85 
 
 		 495 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.04 
 
 		 493 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.36 
 
 		 571 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.65 
 
 		 433 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.33 
 
 		 511 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  37.61 
 
 		 506 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.7 
 
 		 626 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  38.16 
 
 		 629 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 		 486 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.23 
 
 		 433 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.46 
 
 		 433 aa  266  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.49 
 
 		 451 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>