More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0659 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
500 aa  1013    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  88.2 
 
 
482 aa  841    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  62.34 
 
 
516 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1471  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.41 
 
 
649 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.25269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1484  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.99 
 
 
661 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3345  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.9 
 
 
625 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.049503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2693  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.09 
 
 
616 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1894  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.74 
 
 
619 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.97 
 
 
707 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.904936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0325  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.1 
 
 
609 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  51.64 
 
 
623 aa  432  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1701  DEAD/DEAH box helicase-like  52.27 
 
 
624 aa  428  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.19 
 
 
632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  52.44 
 
 
634 aa  402  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  48.64 
 
 
533 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.67 
 
 
502 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.58 
 
 
627 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  50.25 
 
 
608 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.58 
 
 
627 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.78 
 
 
441 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.32 
 
 
456 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  45.54 
 
 
452 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.49 
 
 
556 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  42.54 
 
 
537 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.57 
 
 
450 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.95 
 
 
453 aa  346  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.57 
 
 
454 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  44.91 
 
 
516 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.91 
 
 
516 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  43.34 
 
 
516 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  43.34 
 
 
516 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  43.34 
 
 
516 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.34 
 
 
516 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.91 
 
 
514 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.28 
 
 
505 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.42 
 
 
512 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.53 
 
 
512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  43.34 
 
 
529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  43.34 
 
 
514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  45.25 
 
 
516 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.1 
 
 
482 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  44.03 
 
 
513 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  43.52 
 
 
472 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.39 
 
 
542 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.16 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.23 
 
 
453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.19 
 
 
430 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  42.54 
 
 
567 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  44.24 
 
 
552 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.34 
 
 
516 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  43.94 
 
 
435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.04 
 
 
628 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.37 
 
 
480 aa  299  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.14 
 
 
489 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  42.48 
 
 
540 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.93 
 
 
485 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 
438 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.93 
 
 
485 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  43.93 
 
 
485 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.93 
 
 
485 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.93 
 
 
485 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.93 
 
 
482 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  41.99 
 
 
622 aa  296  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.57 
 
 
626 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.26 
 
 
646 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.58 
 
 
624 aa  295  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.59 
 
 
488 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  42.82 
 
 
574 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.43 
 
 
559 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  41.38 
 
 
641 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.34 
 
 
452 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  41.42 
 
 
477 aa  293  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  43.15 
 
 
484 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.66 
 
 
426 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.15 
 
 
480 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  43.15 
 
 
486 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.15 
 
 
486 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.15 
 
 
486 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2404  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.52 
 
 
407 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.785328  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
479 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.47 
 
 
463 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  44.03 
 
 
473 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.96 
 
 
513 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.43 
 
 
484 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.44 
 
 
663 aa  290  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.38 
 
 
629 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.84 
 
 
630 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.16 
 
 
626 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.86 
 
 
504 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.85 
 
 
511 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.95 
 
 
497 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.99 
 
 
609 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  41.99 
 
 
609 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.1 
 
 
456 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.68 
 
 
454 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  40.68 
 
 
454 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.68 
 
 
454 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.37 
 
 
506 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.95 
 
 
484 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.68 
 
 
454 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>