More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3345 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1484  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.78 
 
 		 661 aa  723    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1471  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.73 
 
 		 649 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.25269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  64.88 
 
 		 623 aa  776    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0325  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.11 
 
 		 609 aa  748    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1701  DEAD/DEAH box helicase-like  61.28 
 
 		 624 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1894  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.52 
 
 		 619 aa  798    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2693  DEAD/DEAH box helicase domain protein  98.08 
 
 		 616 aa  1122    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3345  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 625 aa  1257    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.049503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  54.69 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.61 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.4 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.66 
 
 		 634 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.61 
 
 		 632 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.5 
 
 		 502 aa  360  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.23 
 
 		 556 aa  351  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.07 
 
 		 627 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.07 
 
 		 627 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.64 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  40.93 
 
 		 533 aa  342  9e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  45.67 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.43 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.54 
 
 		 482 aa  340  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  45.43 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.43 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.03 
 
 		 512 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.49 
 
 		 512 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  46.32 
 
 		 608 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  45.45 
 
 		 513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  45.45 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  45.24 
 
 		 514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.45 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  45.45 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  45.45 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  45.45 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  45.45 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.01 
 
 		 542 aa  330  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.43 
 
 		 456 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  43.19 
 
 		 472 aa  319  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.07 
 
 		 441 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.31 
 
 		 450 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  38.43 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.09 
 
 		 430 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.61 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.1 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.94 
 
 		 449 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  40.3 
 
 		 435 aa  297  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  35.3 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  36.47 
 
 		 567 aa  294  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.32 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.24 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.31 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  37.68 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 		 479 aa  278  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.3 
 
 		 418 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.3 
 
 		 418 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.65 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  38.14 
 
 		 492 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.85 
 
 		 497 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.69 
 
 		 487 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.18 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 		 484 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  37.03 
 
 		 516 aa  270  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.31 
 
 		 486 aa  269  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 		 678 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.53 
 
 		 484 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 550 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.66 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.96 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.53 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.91 
 
 		 443 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 		 480 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38.37 
 
 		 559 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  39.53 
 
 		 486 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.53 
 
 		 486 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.26 
 
 		 511 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.53 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.93 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.29 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.41 
 
 		 454 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.48 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.37 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.23 
 
 		 628 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  39.29 
 
 		 484 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.39 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  38.37 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  38.37 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.37 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  38.37 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  38.37 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  37 
 
 		 454 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37 
 
 		 454 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  262  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.22 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.07 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 455 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  38.82 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  37 
 
 		 454 aa  262  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.1 
 
 		 495 aa  261  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>