More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1652 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.28 
 
 
512 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  84.4 
 
 
516 aa  718    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  84.4 
 
 
516 aa  718    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  84.4 
 
 
516 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  84.4 
 
 
529 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  85.78 
 
 
516 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.56 
 
 
556 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.52 
 
 
505 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  84.4 
 
 
516 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  87.89 
 
 
482 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
537 aa  1061    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  92.44 
 
 
542 aa  851    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.67 
 
 
514 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  86.89 
 
 
516 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  83.96 
 
 
514 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.44 
 
 
512 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.89 
 
 
516 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  84.4 
 
 
513 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  59.17 
 
 
634 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.48 
 
 
632 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.76 
 
 
627 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.76 
 
 
627 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  59.75 
 
 
608 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  50.91 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.12 
 
 
456 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.48 
 
 
441 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  50.1 
 
 
533 aa  428  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.77 
 
 
449 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.52 
 
 
453 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.44 
 
 
453 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  51.66 
 
 
435 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  48.94 
 
 
452 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.23 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.11 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.6 
 
 
430 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  46.9 
 
 
552 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.89 
 
 
502 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  42.71 
 
 
567 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
516 aa  379  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0325  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.14 
 
 
609 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45 
 
 
425 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  45.73 
 
 
516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3345  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.68 
 
 
625 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.049503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.12 
 
 
630 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  41.49 
 
 
623 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.91 
 
 
626 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2693  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.14 
 
 
616 aa  350  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.14 
 
 
626 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.65 
 
 
628 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.67 
 
 
451 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.67 
 
 
451 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.42 
 
 
627 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.25 
 
 
477 aa  346  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.78 
 
 
500 aa  346  7e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.98 
 
 
515 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.58 
 
 
476 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.28 
 
 
482 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  43.68 
 
 
543 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.13 
 
 
480 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1484  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.42 
 
 
661 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.13 
 
 
479 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.88 
 
 
486 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  47.1 
 
 
484 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  46.88 
 
 
486 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  42.3 
 
 
495 aa  343  5.999999999999999e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.88 
 
 
486 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.28 
 
 
629 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.27 
 
 
479 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.13 
 
 
482 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1471  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.15 
 
 
649 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.25269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  47.41 
 
 
629 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.3 
 
 
571 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.38 
 
 
485 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.67 
 
 
707 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.904936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.63 
 
 
480 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.35 
 
 
456 aa  340  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.16 
 
 
443 aa  340  5.9999999999999996e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  47.16 
 
 
622 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  45.95 
 
 
579 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.38 
 
 
485 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  47.38 
 
 
485 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.38 
 
 
485 aa  339  9e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  47.38 
 
 
485 aa  339  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.5 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.5 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  45.11 
 
 
574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.88 
 
 
522 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  45.54 
 
 
557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.02 
 
 
452 aa  336  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0924  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.8 
 
 
403 aa  336  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.29 
 
 
577 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.22 
 
 
506 aa  335  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.29 
 
 
578 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  42.66 
 
 
639 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.03 
 
 
488 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  45.27 
 
 
445 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.95 
 
 
462 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.59 
 
 
413 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134965  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  43.55 
 
 
635 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>