More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0325 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1894  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.03 
 
 		 619 aa  773    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1471  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.87 
 
 		 649 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.25269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3345  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.31 
 
 		 625 aa  760    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.049503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2693  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.38 
 
 		 616 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.65 
 
 		 707 aa  726    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  64.16 
 
 		 623 aa  723    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0325  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 609 aa  1227    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1484  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.83 
 
 		 661 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1701  DEAD/DEAH box helicase-like  70.33 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  54.19 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.8 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.35 
 
 		 482 aa  422  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.42 
 
 		 634 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.82 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 		 502 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.7 
 
 		 482 aa  346  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.06 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.3 
 
 		 512 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.22 
 
 		 514 aa  343  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  45.22 
 
 		 516 aa  343  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.22 
 
 		 516 aa  343  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  45.79 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.81 
 
 		 627 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.81 
 
 		 627 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.58 
 
 		 556 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  45.35 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  45.35 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  45.24 
 
 		 514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.35 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  45.35 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.37 
 
 		 512 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  45.35 
 
 		 529 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  45.35 
 
 		 513 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  41.38 
 
 		 533 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  44.85 
 
 		 608 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  44.55 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.08 
 
 		 542 aa  331  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.98 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.17 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  38.3 
 
 		 472 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.38 
 
 		 453 aa  309  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.33 
 
 		 430 aa  306  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40 
 
 		 450 aa  297  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.21 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  37.72 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  40.84 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.58 
 
 		 449 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  35.65 
 
 		 552 aa  287  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.94 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  39.25 
 
 		 567 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.93 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.49 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.93 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.43 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.49 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  37.89 
 
 		 460 aa  269  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.95 
 
 		 545 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.08 
 
 		 433 aa  266  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.49 
 
 		 540 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.44 
 
 		 678 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.92 
 
 		 433 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  41.11 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  261  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 		 504 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37 
 
 		 455 aa  260  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 456 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  37.56 
 
 		 492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.38 
 
 		 452 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  37 
 
 		 454 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37 
 
 		 454 aa  260  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  37 
 
 		 454 aa  260  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  260  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 455 aa  260  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  260  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.41 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  35.08 
 
 		 516 aa  259  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.28 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  37.92 
 
 		 420 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  37.92 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.77 
 
 		 454 aa  258  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.1 
 
 		 484 aa  258  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3080  ATP-dependent RNA helicase SrmB  38.53 
 
 		 441 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.45 
 
 		 433 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.16 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.3 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38 
 
 		 571 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  38.55 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.51 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.51 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.55 
 
 		 509 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.51 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38 
 
 		 559 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.51 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 		 497 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.97 
 
 		 506 aa  256  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.88 
 
 		 459 aa  256  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.45 
 
 		 433 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.3 
 
 		 487 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>