More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5980 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
571 aa  1129    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.9 
 
 
469 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.47 
 
 
461 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.73 
 
 
501 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.41 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.85 
 
 
502 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.25 
 
 
489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.44 
 
 
462 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.11 
 
 
854 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.9 
 
 
530 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.2 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.79 
 
 
741 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.1 
 
 
508 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.3 
 
 
566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.69 
 
 
635 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  53 
 
 
573 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.17 
 
 
631 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.03 
 
 
444 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.94 
 
 
453 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.33 
 
 
474 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.03 
 
 
444 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.03 
 
 
444 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.14 
 
 
491 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.96 
 
 
443 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.32 
 
 
491 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.28 
 
 
468 aa  388  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.91 
 
 
392 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.69 
 
 
476 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.64 
 
 
507 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.13 
 
 
507 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.51 
 
 
467 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.63 
 
 
498 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.6 
 
 
551 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.76 
 
 
446 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.49 
 
 
636 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.6 
 
 
590 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  45.87 
 
 
607 aa  363  7.0000000000000005e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.24 
 
 
512 aa  360  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.91 
 
 
503 aa  360  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.15 
 
 
456 aa  356  5.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  37.73 
 
 
728 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  49.03 
 
 
374 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.93 
 
 
559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
549 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
549 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.07 
 
 
535 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.6 
 
 
578 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  39.74 
 
 
477 aa  289  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  40.97 
 
 
445 aa  289  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.43 
 
 
467 aa  289  9e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  43.39 
 
 
476 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 
550 aa  286  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.4 
 
 
513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.78 
 
 
525 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.52 
 
 
511 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.86 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.78 
 
 
515 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.74 
 
 
494 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.78 
 
 
525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.21 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.78 
 
 
526 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.1 
 
 
544 aa  282  9e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.74 
 
 
477 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  42.53 
 
 
491 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.71 
 
 
460 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  37.6 
 
 
469 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.46 
 
 
480 aa  281  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.17 
 
 
514 aa  281  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.06 
 
 
533 aa  281  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  42.53 
 
 
482 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 
443 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  42.41 
 
 
429 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.74 
 
 
479 aa  277  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 
506 aa  277  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.22 
 
 
525 aa  277  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.67 
 
 
474 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.44 
 
 
452 aa  276  5e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 
580 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.35 
 
 
522 aa  276  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.05 
 
 
495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.83 
 
 
437 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.64 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  43.09 
 
 
593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  41.67 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  43.54 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  36.79 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.67 
 
 
533 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.82 
 
 
485 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.74 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  42.86 
 
 
697 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.12 
 
 
545 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.74 
 
 
506 aa  273  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.9 
 
 
540 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.16 
 
 
567 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  42.21 
 
 
510 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  37.72 
 
 
460 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0304  hypothetical protein  40.38 
 
 
414 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.46 
 
 
503 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.66 
 
 
452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.05 
 
 
536 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>