More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4508 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
469 aa  908    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  93.71 
 
 
461 aa  830    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.41 
 
 
571 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.73 
 
 
501 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.06 
 
 
449 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.58 
 
 
502 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.9 
 
 
854 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.05 
 
 
462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.42 
 
 
544 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.76 
 
 
489 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.2 
 
 
566 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.11 
 
 
741 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.24 
 
 
508 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.21 
 
 
530 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.06 
 
 
507 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.47 
 
 
474 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.46 
 
 
444 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.46 
 
 
444 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.46 
 
 
444 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.78 
 
 
631 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.04 
 
 
635 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.15 
 
 
573 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.3 
 
 
507 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 
491 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.5 
 
 
491 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.78 
 
 
456 aa  364  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.6 
 
 
468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.82 
 
 
443 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.11 
 
 
453 aa  362  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.02 
 
 
467 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.13 
 
 
392 aa  359  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.21 
 
 
590 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.51 
 
 
446 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.84 
 
 
498 aa  351  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  46.1 
 
 
607 aa  350  4e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.12 
 
 
636 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.39 
 
 
476 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  46.54 
 
 
728 aa  346  6e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.64 
 
 
503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.99 
 
 
512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.88 
 
 
551 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.53 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  44.63 
 
 
482 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  39.91 
 
 
476 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  43.8 
 
 
491 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.59 
 
 
559 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.39 
 
 
535 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  40.05 
 
 
477 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.53 
 
 
515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.6 
 
 
497 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 
525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 
525 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 
526 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.37 
 
 
550 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 
578 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 
549 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  40.99 
 
 
445 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.88 
 
 
480 aa  281  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 
463 aa  279  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  39.78 
 
 
469 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
393 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  51.79 
 
 
374 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.48 
 
 
514 aa  277  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 
494 aa  277  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.25 
 
 
525 aa  276  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.17 
 
 
477 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.85 
 
 
533 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.87 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.71 
 
 
474 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.33 
 
 
496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.25 
 
 
508 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 
513 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.12 
 
 
491 aa  273  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.21 
 
 
479 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.42 
 
 
545 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 
511 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  41.67 
 
 
481 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0304  hypothetical protein  39.44 
 
 
414 aa  271  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  39.53 
 
 
495 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.71 
 
 
414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  38.89 
 
 
414 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1767  DEAD/DEAH box helicase-like  39.48 
 
 
540 aa  270  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 
443 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.06 
 
 
461 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.79 
 
 
593 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  38.16 
 
 
557 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.79 
 
 
452 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  39.83 
 
 
527 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  39.7 
 
 
460 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  42.78 
 
 
461 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  40 
 
 
516 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.66 
 
 
463 aa  268  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  41.69 
 
 
429 aa  267  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.08 
 
 
528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  40.95 
 
 
622 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.83 
 
 
528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.83 
 
 
528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  40.77 
 
 
551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.09 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>