More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4088 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  93.71 
 
 		 469 aa  830    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 461 aa  891    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.16 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.59 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.84 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.29 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.05 
 
 		 854 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.05 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.35 
 
 		 489 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.86 
 
 		 566 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.39 
 
 		 544 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.68 
 
 		 741 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.22 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.45 
 
 		 530 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.21 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.79 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.36 
 
 		 507 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.79 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.79 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.09 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.01 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.88 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.26 
 
 		 635 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.11 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.36 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.06 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.11 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.99 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.88 
 
 		 443 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.08 
 
 		 468 aa  358  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.26 
 
 		 590 aa  358  9e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.62 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  46.23 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.98 
 
 		 446 aa  349  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.51 
 
 		 476 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.32 
 
 		 498 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  47.06 
 
 		 728 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.63 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.4 
 
 		 503 aa  340  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.63 
 
 		 551 aa  332  8e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.73 
 
 		 512 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.55 
 
 		 467 aa  296  7e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  40.17 
 
 		 491 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  40.44 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  41.59 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.38 
 
 		 559 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  40.04 
 
 		 476 aa  289  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.39 
 
 		 535 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 		 549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.24 
 
 		 515 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.24 
 
 		 526 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.24 
 
 		 525 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 		 578 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.24 
 
 		 525 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.82 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.17 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.88 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.04 
 
 		 550 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.38 
 
 		 525 aa  279  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.57 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.53 
 
 		 494 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  44.83 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  40.38 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  40.7 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.77 
 
 		 514 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.24 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  42.82 
 
 		 481 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.99 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 		 463 aa  276  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.17 
 
 		 477 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  51.14 
 
 		 374 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.71 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  40.12 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  44.23 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.79 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.12 
 
 		 491 aa  272  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.04 
 
 		 496 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.54 
 
 		 508 aa  272  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.63 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.86 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.06 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 		 511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  43.34 
 
 		 461 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.93 
 
 		 479 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0304  hypothetical protein  39.44 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.08 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.09 
 
 		 459 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.5 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.34 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0320  hypothetical protein  38.61 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.33 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  41.5 
 
 		 622 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.81 
 
 		 506 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.6 
 
 		 626 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  40 
 
 		 516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.46 
 
 		 466 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  41.95 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  41.69 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.87 
 
 		 522 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1767  DEAD/DEAH box helicase-like  39.63 
 
 		 540 aa  266  5e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>