More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2474 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1082    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.76 
 
 		 741 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.42 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.5 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.29 
 
 		 854 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.2 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.82 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.08 
 
 		 449 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.71 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.96 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.91 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.14 
 
 		 566 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.3 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.52 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.17 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.13 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.67 
 
 		 635 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.52 
 
 		 631 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.16 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.16 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.16 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.34 
 
 		 443 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.05 
 
 		 456 aa  359  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.11 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.27 
 
 		 507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.05 
 
 		 503 aa  356  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.82 
 
 		 590 aa  353  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.98 
 
 		 573 aa  352  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.7 
 
 		 636 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.44 
 
 		 392 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.72 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.41 
 
 		 476 aa  343  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.74 
 
 		 512 aa  342  7e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.27 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.32 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.86 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.22 
 
 		 551 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.82 
 
 		 453 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.73 
 
 		 467 aa  333  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  36.74 
 
 		 728 aa  322  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  44.83 
 
 		 607 aa  317  3e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.32 
 
 		 467 aa  286  9e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  54.39 
 
 		 374 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.32 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.16 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 		 525 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 		 526 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 		 525 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  44.96 
 
 		 482 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  44.67 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.69 
 
 		 535 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  41.82 
 
 		 644 aa  273  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.42 
 
 		 618 aa  272  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.56 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.02 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  41.29 
 
 		 445 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.19 
 
 		 514 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  42.77 
 
 		 481 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.06 
 
 		 477 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.06 
 
 		 513 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.24 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.34 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.1 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.92 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  43.64 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  41.91 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 549 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.53 
 
 		 498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.63 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.09 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.48 
 
 		 494 aa  267  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.84 
 
 		 499 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.37 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.27 
 
 		 503 aa  266  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  41.91 
 
 		 477 aa  266  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.86 
 
 		 559 aa  266  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  43.85 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.26 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  44 
 
 		 697 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  42.53 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.59 
 
 		 495 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.97 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.85 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  43.85 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.85 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.49 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  43.85 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.35 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  43.85 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  43.85 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  44.25 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  43.35 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.23 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.27 
 
 		 628 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.05 
 
 		 582 aa  264  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.41 
 
 		 460 aa  264  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.41 
 
 		 471 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.63 
 
 		 559 aa  263  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.9 
 
 		 536 aa  263  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>