More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 
507 aa  988    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.23 
 
 
741 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.06 
 
 
469 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.75 
 
 
449 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.81 
 
 
461 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 
571 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.59 
 
 
501 aa  360  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.41 
 
 
854 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.85 
 
 
489 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.75 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.26 
 
 
502 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.72 
 
 
544 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.76 
 
 
530 aa  345  8e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.01 
 
 
635 aa  335  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.01 
 
 
631 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.95 
 
 
573 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.01 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.01 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.01 
 
 
444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.14 
 
 
491 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.44 
 
 
507 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.94 
 
 
443 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.93 
 
 
474 aa  323  6e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.72 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.39 
 
 
468 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.9 
 
 
508 aa  319  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.63 
 
 
498 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.56 
 
 
636 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.21 
 
 
392 aa  317  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.44 
 
 
453 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.72 
 
 
503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.95 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.93 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.2 
 
 
566 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.91 
 
 
491 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  42.26 
 
 
728 aa  302  8.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.22 
 
 
476 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.43 
 
 
590 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.24 
 
 
446 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.09 
 
 
551 aa  291  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  42.82 
 
 
607 aa  282  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.71 
 
 
550 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
598 aa  266  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.09 
 
 
438 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.09 
 
 
436 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.07 
 
 
467 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.06 
 
 
525 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.58 
 
 
495 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  39.6 
 
 
574 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.55 
 
 
599 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.87 
 
 
436 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
526 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.87 
 
 
511 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 
463 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.06 
 
 
525 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  36.42 
 
 
469 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.21 
 
 
515 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  35.54 
 
 
477 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  36.48 
 
 
460 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  35.59 
 
 
491 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  39.53 
 
 
445 aa  256  9e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.84 
 
 
535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  42.06 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.41 
 
 
496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  37.23 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.04 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  42.12 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.94 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.11 
 
 
549 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.11 
 
 
578 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
549 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.37 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.66 
 
 
443 aa  253  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.34 
 
 
510 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.13 
 
 
474 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.75 
 
 
559 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.34 
 
 
510 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.41 
 
 
499 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.79 
 
 
506 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.95 
 
 
494 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
453 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  36.71 
 
 
446 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
453 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.88 
 
 
418 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
453 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  40.16 
 
 
697 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
453 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
453 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.72 
 
 
506 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  37.59 
 
 
557 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.24 
 
 
491 aa  249  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  36.29 
 
 
476 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  38.29 
 
 
579 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
454 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
513 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.43 
 
 
581 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
454 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.55 
 
 
455 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>