More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2243 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
551 aa  1056    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  74.87 
 
 
503 aa  535  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  70.87 
 
 
512 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.62 
 
 
631 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.36 
 
 
635 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.16 
 
 
474 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.58 
 
 
530 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.58 
 
 
636 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  65.08 
 
 
456 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.57 
 
 
468 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.47 
 
 
444 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  67.47 
 
 
444 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.47 
 
 
444 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.11 
 
 
443 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.97 
 
 
491 aa  476  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.92 
 
 
392 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.45 
 
 
476 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.28 
 
 
573 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.09 
 
 
453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.04 
 
 
467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.97 
 
 
498 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.88 
 
 
507 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.74 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  46.24 
 
 
728 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.18 
 
 
449 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  53.45 
 
 
607 aa  396  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.91 
 
 
571 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.59 
 
 
501 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.38 
 
 
741 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.47 
 
 
508 aa  364  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.56 
 
 
461 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.56 
 
 
469 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.04 
 
 
446 aa  356  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.22 
 
 
544 aa  352  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.93 
 
 
502 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.87 
 
 
489 aa  346  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.96 
 
 
854 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.58 
 
 
590 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.69 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.73 
 
 
566 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.18 
 
 
507 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  53.44 
 
 
374 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.9 
 
 
448 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.83 
 
 
499 aa  294  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.81 
 
 
506 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.01 
 
 
423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  42.18 
 
 
491 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.03 
 
 
506 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.28 
 
 
506 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.01 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  46.7 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.01 
 
 
510 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.48 
 
 
559 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  42.15 
 
 
622 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.88 
 
 
629 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  43.36 
 
 
481 aa  279  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  41.88 
 
 
629 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  39.6 
 
 
460 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.81 
 
 
459 aa  278  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  42.61 
 
 
482 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  41.64 
 
 
446 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.04 
 
 
452 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  41.94 
 
 
635 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  42.05 
 
 
639 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.87 
 
 
463 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.57 
 
 
480 aa  273  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 
627 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  43.84 
 
 
477 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.78 
 
 
626 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.19 
 
 
628 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.04 
 
 
418 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.23 
 
 
485 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 
630 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.62 
 
 
626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  39.82 
 
 
476 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  39.45 
 
 
460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.6 
 
 
503 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
479 aa  269  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.98 
 
 
462 aa  269  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.2 
 
 
423 aa  269  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.79 
 
 
593 aa  269  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.29 
 
 
497 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.85 
 
 
471 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  44.73 
 
 
697 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.21 
 
 
441 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.82 
 
 
495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  43.51 
 
 
393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  34.99 
 
 
527 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.64 
 
 
544 aa  267  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.21 
 
 
580 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  42.47 
 
 
557 aa  267  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.99 
 
 
567 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.35 
 
 
491 aa  266  8e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  43.23 
 
 
445 aa  266  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.08 
 
 
582 aa  266  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.37 
 
 
474 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.76 
 
 
454 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.76 
 
 
454 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  42.74 
 
 
445 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  41.47 
 
 
429 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>