More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3485 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
636 aa  1214    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.33 
 
 
503 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  71.65 
 
 
512 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.1 
 
 
468 aa  555  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.98 
 
 
530 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.45 
 
 
443 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.27 
 
 
444 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  64.27 
 
 
444 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.27 
 
 
444 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.31 
 
 
635 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.8 
 
 
631 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.92 
 
 
474 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.57 
 
 
456 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.32 
 
 
551 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.49 
 
 
491 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.48 
 
 
476 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.67 
 
 
392 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  66.03 
 
 
573 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.14 
 
 
507 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.09 
 
 
453 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  53.05 
 
 
728 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.18 
 
 
467 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.47 
 
 
498 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.81 
 
 
491 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  54.9 
 
 
741 aa  416  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  51.7 
 
 
607 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.24 
 
 
571 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.27 
 
 
449 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.22 
 
 
502 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
489 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.96 
 
 
501 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.63 
 
 
544 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.88 
 
 
462 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.61 
 
 
469 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.12 
 
 
508 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.62 
 
 
461 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.24 
 
 
854 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.33 
 
 
446 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.09 
 
 
590 aa  351  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.1 
 
 
507 aa  340  5e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.38 
 
 
566 aa  339  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.97 
 
 
499 aa  303  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.9 
 
 
423 aa  300  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  39.01 
 
 
446 aa  299  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  51.91 
 
 
374 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.59 
 
 
463 aa  297  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.86 
 
 
480 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.93 
 
 
506 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.07 
 
 
497 aa  290  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.99 
 
 
448 aa  290  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  37.25 
 
 
635 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.18 
 
 
452 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  37.1 
 
 
639 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.85 
 
 
629 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.46 
 
 
494 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  41.3 
 
 
622 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.83 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  41.85 
 
 
629 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  34.82 
 
 
527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.61 
 
 
513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.91 
 
 
522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  37.55 
 
 
543 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.02 
 
 
549 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.63 
 
 
618 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.16 
 
 
525 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.37 
 
 
491 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.76 
 
 
628 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.08 
 
 
506 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.52 
 
 
626 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.34 
 
 
462 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.64 
 
 
451 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.45 
 
 
515 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.85 
 
 
447 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36 
 
 
515 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  43.89 
 
 
418 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.87 
 
 
514 aa  280  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.98 
 
 
626 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.5 
 
 
535 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.23 
 
 
578 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.79 
 
 
526 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.17 
 
 
599 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.67 
 
 
525 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.38 
 
 
485 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.77 
 
 
445 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.67 
 
 
525 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.29 
 
 
492 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  35.47 
 
 
424 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  41.89 
 
 
557 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.82 
 
 
559 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  43.78 
 
 
469 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.76 
 
 
627 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.28 
 
 
467 aa  278  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.95 
 
 
496 aa  278  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  43.05 
 
 
477 aa  278  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  39.86 
 
 
485 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.77 
 
 
477 aa  278  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.96 
 
 
510 aa  278  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.96 
 
 
510 aa  278  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.18 
 
 
423 aa  277  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.01 
 
 
540 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>