More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 
456 aa  892    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  68.11 
 
 
512 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.75 
 
 
503 aa  501  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.18 
 
 
635 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.21 
 
 
474 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.42 
 
 
631 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.62 
 
 
636 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.93 
 
 
530 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.82 
 
 
468 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.5 
 
 
443 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.71 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.08 
 
 
551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.71 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.71 
 
 
444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.5 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.22 
 
 
491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.51 
 
 
573 aa  448  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.75 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  51.46 
 
 
728 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.77 
 
 
507 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.58 
 
 
453 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.09 
 
 
467 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  52.76 
 
 
607 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.53 
 
 
491 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.95 
 
 
498 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.59 
 
 
449 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.78 
 
 
469 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.06 
 
 
461 aa  362  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.05 
 
 
544 aa  359  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.17 
 
 
741 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.13 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.15 
 
 
571 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
489 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.85 
 
 
502 aa  352  8.999999999999999e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.77 
 
 
501 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.74 
 
 
462 aa  348  9e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.25 
 
 
590 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.69 
 
 
566 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.86 
 
 
446 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.84 
 
 
854 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.72 
 
 
507 aa  323  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39 
 
 
499 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.28 
 
 
423 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  44.44 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.32 
 
 
503 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.9 
 
 
506 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.03 
 
 
544 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.76 
 
 
423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.93 
 
 
448 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  48.05 
 
 
374 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.21 
 
 
459 aa  270  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  39.47 
 
 
398 aa  268  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.54 
 
 
510 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.29 
 
 
506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  41.58 
 
 
481 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.84 
 
 
477 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.29 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  42.86 
 
 
697 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.14 
 
 
474 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  38.22 
 
 
622 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.06 
 
 
467 aa  263  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 
628 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.24 
 
 
565 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.02 
 
 
618 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.24 
 
 
560 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  39.61 
 
 
446 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.8 
 
 
506 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  39.25 
 
 
540 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  34.22 
 
 
445 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.89 
 
 
452 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.7 
 
 
479 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.56 
 
 
426 aa  260  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.6 
 
 
591 aa  259  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  39.28 
 
 
482 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.74 
 
 
626 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.94 
 
 
511 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 
507 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.16 
 
 
509 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  38.72 
 
 
491 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.25 
 
 
507 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.25 
 
 
507 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.81 
 
 
629 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.27 
 
 
537 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  41.03 
 
 
476 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.06 
 
 
418 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  40.44 
 
 
527 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  39.11 
 
 
557 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.06 
 
 
496 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.2 
 
 
582 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 
627 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.81 
 
 
438 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40 
 
 
482 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  40 
 
 
559 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  35.94 
 
 
635 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40 
 
 
482 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.48 
 
 
626 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.78 
 
 
550 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  40 
 
 
482 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  40 
 
 
482 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>