More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0649 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  100 
 
 
728 aa  1477    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  60.62 
 
 
607 aa  502  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.38 
 
 
491 aa  446  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.69 
 
 
444 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57 
 
 
476 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.69 
 
 
444 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.73 
 
 
635 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.69 
 
 
444 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.71 
 
 
636 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.01 
 
 
631 aa  432  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.47 
 
 
468 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.46 
 
 
456 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54 
 
 
474 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.72 
 
 
443 aa  422  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.62 
 
 
530 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.81 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.72 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.97 
 
 
512 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.92 
 
 
573 aa  388  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.27 
 
 
551 aa  382  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.63 
 
 
741 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.65 
 
 
854 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.79 
 
 
507 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.13 
 
 
491 aa  358  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.3 
 
 
498 aa  353  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.56 
 
 
449 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.64 
 
 
467 aa  346  8.999999999999999e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.54 
 
 
469 aa  346  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.06 
 
 
461 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.6 
 
 
453 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.81 
 
 
502 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.94 
 
 
571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.34 
 
 
501 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.97 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.59 
 
 
489 aa  326  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.11 
 
 
508 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
544 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.89 
 
 
566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 
590 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.96 
 
 
446 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.26 
 
 
507 aa  298  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.18 
 
 
565 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  46.75 
 
 
374 aa  264  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  38.68 
 
 
635 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  38.68 
 
 
639 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.53 
 
 
559 aa  258  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.89 
 
 
565 aa  257  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.6 
 
 
628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  38.14 
 
 
557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.61 
 
 
543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.72 
 
 
559 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.15 
 
 
460 aa  254  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.85 
 
 
479 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.18 
 
 
448 aa  253  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.52 
 
 
586 aa  253  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  39.23 
 
 
697 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.8 
 
 
618 aa  252  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  38.61 
 
 
469 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.07 
 
 
506 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.95 
 
 
599 aa  250  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.36 
 
 
598 aa  250  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.56 
 
 
499 aa  250  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 
626 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  42.29 
 
 
649 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.41 
 
 
427 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.99 
 
 
581 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.64 
 
 
582 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  36.58 
 
 
622 aa  249  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.84 
 
 
611 aa  249  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.84 
 
 
629 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.44 
 
 
580 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  35.37 
 
 
510 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.5 
 
 
591 aa  248  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  36.84 
 
 
629 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 
497 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.6 
 
 
471 aa  247  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  37.27 
 
 
476 aa  247  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.1 
 
 
423 aa  247  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.12 
 
 
513 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.25 
 
 
471 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.78 
 
 
578 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.16 
 
 
536 aa  246  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.57 
 
 
506 aa  246  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.5 
 
 
609 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.82 
 
 
423 aa  246  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 
491 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.44 
 
 
459 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.62 
 
 
511 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  40.51 
 
 
527 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.9 
 
 
510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.44 
 
 
567 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.5 
 
 
451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
630 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  37 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.68 
 
 
626 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
627 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.9 
 
 
510 aa  245  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.66 
 
 
657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.06 
 
 
499 aa  244  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.72 
 
 
467 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>