More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4394 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
508 aa  987    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.39 
 
 
461 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.53 
 
 
469 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.6 
 
 
571 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.3 
 
 
854 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.73 
 
 
449 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.57 
 
 
474 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.77 
 
 
501 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.12 
 
 
502 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  51.91 
 
 
741 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.23 
 
 
530 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.17 
 
 
544 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.03 
 
 
590 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.78 
 
 
507 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.62 
 
 
573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.26 
 
 
456 aa  361  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.43 
 
 
635 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.52 
 
 
491 aa  359  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.91 
 
 
631 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.06 
 
 
467 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.59 
 
 
446 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.88 
 
 
453 aa  352  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.5 
 
 
503 aa  352  8e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.06 
 
 
468 aa  350  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.49 
 
 
443 aa  349  7e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.66 
 
 
512 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.98 
 
 
489 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.21 
 
 
551 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.87 
 
 
462 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.25 
 
 
566 aa  347  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
491 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.87 
 
 
636 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.4 
 
 
444 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.4 
 
 
444 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.4 
 
 
444 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.09 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.72 
 
 
476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  44.21 
 
 
728 aa  327  3e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  47.06 
 
 
498 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  44.5 
 
 
607 aa  323  5e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.9 
 
 
507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.22 
 
 
467 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.3 
 
 
559 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  44.17 
 
 
697 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.31 
 
 
536 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  55.09 
 
 
374 aa  279  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.36 
 
 
586 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  39.71 
 
 
460 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.28 
 
 
621 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.69 
 
 
565 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  46.26 
 
 
499 aa  276  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.11 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.84 
 
 
618 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.56 
 
 
548 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
505 aa  273  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.85 
 
 
497 aa  273  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.02 
 
 
494 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.68 
 
 
508 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.04 
 
 
463 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.05 
 
 
609 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.83 
 
 
611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 
514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.56 
 
 
565 aa  270  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.86 
 
 
460 aa  269  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.13 
 
 
498 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.35 
 
 
503 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.04 
 
 
561 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.31 
 
 
543 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  41.64 
 
 
445 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.25 
 
 
507 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.32 
 
 
471 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.45 
 
 
507 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.68 
 
 
580 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.45 
 
 
507 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.25 
 
 
506 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.26 
 
 
527 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.6 
 
 
611 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.8 
 
 
491 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.1 
 
 
557 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.17 
 
 
585 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.92 
 
 
545 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.49 
 
 
422 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 
492 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  43.13 
 
 
649 aa  263  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0924  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.93 
 
 
403 aa  262  8e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
489 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  43.06 
 
 
593 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.77 
 
 
626 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  41.64 
 
 
421 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  41.42 
 
 
527 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.09 
 
 
628 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  41.08 
 
 
419 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  42.38 
 
 
460 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.91 
 
 
497 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  38.43 
 
 
543 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.52 
 
 
533 aa  259  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.47 
 
 
582 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.41 
 
 
515 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 
455 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.74 
 
 
598 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>