More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4476 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  81.96 
 
 		 489 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 462 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.36 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.57 
 
 		 449 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.05 
 
 		 469 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.05 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5853  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.32 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.72 
 
 		 571 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.41 
 
 		 854 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.91 
 
 		 544 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  53.42 
 
 		 741 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.53 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.18 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.31 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.82 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 635 aa  365  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.74 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.49 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.92 
 
 		 530 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.33 
 
 		 631 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.38 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.21 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.8 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.88 
 
 		 636 aa  353  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.25 
 
 		 476 aa  353  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  50.14 
 
 		 573 aa  352  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.74 
 
 		 456 aa  349  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.48 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.4 
 
 		 503 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  52.08 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  48.43 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.91 
 
 		 467 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.16 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  44.37 
 
 		 728 aa  331  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  47.21 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.31 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.89 
 
 		 590 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.31 
 
 		 551 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2865  helicase-like  51.63 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.88 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  39.44 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.54 
 
 		 571 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0924  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  40.59 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.59 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  40.59 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  38.44 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  40.59 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  40.59 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.59 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.57 
 
 		 535 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 		 549 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.23 
 
 		 471 aa  265  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 		 578 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  39.29 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38.89 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.22 
 
 		 549 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  40.05 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  39.45 
 
 		 482 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1915  DEAD/DEAH box helicase  43.34 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.41 
 
 		 513 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  40.27 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  42.2 
 
 		 640 aa  263  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.22 
 
 		 494 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.97 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.7 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.5 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.62 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.82 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  38.82 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.82 
 
 		 520 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  39.43 
 
 		 574 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.89 
 
 		 509 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.55 
 
 		 595 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.99 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.36 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.15 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.41 
 
 		 537 aa  259  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.78 
 
 		 463 aa  259  9e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.99 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.22 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.82 
 
 		 473 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.45 
 
 		 590 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  39.15 
 
 		 527 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.74 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 		 526 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.39 
 
 		 515 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.5 
 
 		 556 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 		 525 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.89 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 		 525 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.55 
 
 		 506 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.8 
 
 		 525 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  35.89 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.08 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  39.42 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.94 
 
 		 496 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>