More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4567 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
507 aa  985    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4741  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.58 
 
 
491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22250  DNA/RNA helicase, superfamily II  70.47 
 
 
573 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.213053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07770  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.61 
 
 
498 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3844  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.11 
 
 
474 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4634  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.75 
 
 
453 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.49 
 
 
467 aa  502  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.598984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1242  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.88 
 
 
530 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000201686  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2165  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.92 
 
 
444 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2152  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.92 
 
 
444 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.972666  hitchhiker  0.00678012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2211  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.92 
 
 
444 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  0.0408968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33700  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.53 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3959  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.94 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0805  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.37 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3499  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.75 
 
 
631 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.14 
 
 
636 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.96 
 
 
635 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2437  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.67 
 
 
443 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0984806  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.81 
 
 
503 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.22 
 
 
491 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17480  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.77 
 
 
456 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.88 
 
 
551 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.25369  decreased coverage  0.000125069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3424  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.74 
 
 
476 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5980  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.11 
 
 
571 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252652  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10490  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.4 
 
 
741 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  43.99 
 
 
728 aa  379  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  49.43 
 
 
449 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1127  DEAD/DEAH box helicase  48.93 
 
 
607 aa  372  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.652851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4394  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.91 
 
 
508 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.57 
 
 
461 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2700  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.63 
 
 
502 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4508  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.78 
 
 
469 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.563647  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.75 
 
 
462 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.27 
 
 
544 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1264  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.25 
 
 
489 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0858  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.5 
 
 
590 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38687  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1681  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.43 
 
 
854 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12580  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.73 
 
 
507 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2799  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.54 
 
 
566 aa  325  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306701  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.43 
 
 
446 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169963  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  36.63 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.35 
 
 
423 aa  306  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.78 
 
 
448 aa  299  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  43.36 
 
 
622 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.09 
 
 
629 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  43.09 
 
 
629 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
626 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.35 
 
 
463 aa  292  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.8 
 
 
439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  40.17 
 
 
460 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.27 
 
 
479 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0286  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.26 
 
 
467 aa  289  9e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.53 
 
 
628 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.31 
 
 
630 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  40.98 
 
 
540 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.31 
 
 
626 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.44 
 
 
513 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  42.86 
 
 
557 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.31 
 
 
627 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2582  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.86 
 
 
427 aa  286  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.397451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.99 
 
 
565 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.12 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  48.25 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.72 
 
 
560 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.47 
 
 
471 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  39.81 
 
 
418 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.42 
 
 
447 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.08 
 
 
591 aa  283  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 
479 aa  282  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.63 
 
 
471 aa  282  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.54 
 
 
425 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  36.4 
 
 
635 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  44.54 
 
 
574 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.25 
 
 
571 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.47 
 
 
453 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.77 
 
 
507 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.73 
 
 
599 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 
507 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.77 
 
 
507 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  34.96 
 
 
495 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.77 
 
 
452 aa  280  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.53 
 
 
418 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.24 
 
 
451 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.6 
 
 
540 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.41 
 
 
466 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.71 
 
 
447 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.98 
 
 
598 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.85 
 
 
462 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.79 
 
 
525 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.79 
 
 
515 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  41.96 
 
 
639 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.13 
 
 
447 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.79 
 
 
526 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.7 
 
 
418 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.79 
 
 
525 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.29 
 
 
514 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.01 
 
 
618 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.36 
 
 
535 aa  277  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.95 
 
 
494 aa  277  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  34.81 
 
 
527 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>